231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1328 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 313 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  87.62 
 
 		 309 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  62.9 
 
 		 304 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  56.21 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  58.09 
 
 		 305 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  62.86 
 
 		 305 aa  358  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  58.09 
 
 		 311 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  58.09 
 
 		 311 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  57.1 
 
 		 311 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  58.28 
 
 		 301 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  60.14 
 
 		 302 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  57.38 
 
 		 304 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  57.38 
 
 		 304 aa  349  4e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  56.25 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  59.8 
 
 		 302 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  55.92 
 
 		 304 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.84 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  53.59 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  56.77 
 
 		 310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  56.8 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  55.92 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  57.14 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  57 
 
 		 300 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  55.04 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  57 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  57 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  55.26 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  56 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  55.67 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  56.8 
 
 		 304 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  56.8 
 
 		 304 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  55.33 
 
 		 300 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  58.36 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  55.7 
 
 		 300 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  56.8 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  56.46 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  56.46 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  56.46 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  56.46 
 
 		 300 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  51.3 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  54.39 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  50.97 
 
 		 311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  57.75 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.84 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.84 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.25 
 
 		 304 aa  295  7e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  47.73 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.32 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.1 
 
 		 304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  47.23 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  48.73 
 
 		 317 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  50.17 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  50.17 
 
 		 316 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  48.55 
 
 		 314 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  47.08 
 
 		 311 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  48.23 
 
 		 314 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  50 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  39.71 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.94 
 
 		 275 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.53 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.16 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  33.64 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.77 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  35.16 
 
 		 296 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.09 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  34.97 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  36.08 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  34.59 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.21 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.35 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.76 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.46 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  34.33 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.69 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.4 
 
 		 312 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  30.84 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.38 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.46 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.54 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  32.62 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  31.35 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.57 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  33.19 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.01 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.22 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.46 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  33.05 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.93 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.47 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.86 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.65 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  33.58 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.92 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  32.83 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>