228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3196 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  78.15 
 
 		 302 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  79.31 
 
 		 301 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  76.51 
 
 		 301 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  73.83 
 
 		 306 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.92 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.22 
 
 		 287 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51.42 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.6 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  46.71 
 
 		 279 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.82 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  45.67 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  44.03 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 309 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.47 
 
 		 290 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  44.48 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.75 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.68 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.69 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  45.3 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  43.01 
 
 		 301 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  48.3 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.74 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.39 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  42.05 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.61 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.29 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  43.01 
 
 		 289 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.06 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  43.36 
 
 		 287 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.31 
 
 		 283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  41.03 
 
 		 329 aa  225  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  42.16 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  41.6 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.46 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.96 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  44.91 
 
 		 296 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.16 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  40.14 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.8 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.52 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.13 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.66 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  37.97 
 
 		 297 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.92 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.31 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.82 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  34.16 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.17 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.81 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.1 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.8 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  34.45 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  30.11 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  34.33 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  32.76 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  31.44 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  30.39 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  33.92 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  34.29 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  32.98 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  30.8 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  34.15 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.58 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  32.61 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  32.95 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  30.3 
 
 		 311 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  30.53 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  31.37 
 
 		 307 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.13 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.13 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  33.85 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.45 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  29.29 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  33.58 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  29.7 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  30.99 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.96 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  29.86 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  30.34 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  29.37 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  29.86 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  32.84 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  29.14 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  28.03 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  29.68 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  32.84 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  32.84 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>