224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4486 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
308 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  95.21 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  76.19 
 
 
294 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  71.33 
 
 
293 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  70.03 
 
 
287 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  69.42 
 
 
290 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  67.25 
 
 
301 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  65.64 
 
 
289 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  66.44 
 
 
279 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  59.72 
 
 
276 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.21 
 
 
287 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.4 
 
 
287 aa  310  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.64 
 
 
297 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.47 
 
 
300 aa  299  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.32 
 
 
304 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.83 
 
 
303 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.23 
 
 
306 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.12 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  48.97 
 
 
306 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.35 
 
 
299 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.26 
 
 
290 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.76 
 
 
290 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.88 
 
 
309 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.57 
 
 
283 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  45.17 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  46.42 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.72 
 
 
293 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.08 
 
 
301 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  48.28 
 
 
278 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  48.96 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.88 
 
 
295 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  44.75 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  45.8 
 
 
309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  44.4 
 
 
334 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  48.81 
 
 
296 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  43.24 
 
 
328 aa  233  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.24 
 
 
300 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  43.75 
 
 
307 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.16 
 
 
312 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.85 
 
 
288 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.98 
 
 
297 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.91 
 
 
297 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.68 
 
 
287 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.93 
 
 
296 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  38.3 
 
 
297 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.27 
 
 
287 aa  185  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.27 
 
 
275 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.33 
 
 
317 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  34.52 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.87 
 
 
295 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  35.52 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.6 
 
 
297 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  30.91 
 
 
255 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.97 
 
 
307 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  33.33 
 
 
302 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  32.47 
 
 
300 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  33.09 
 
 
300 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  34.02 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  32.46 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  33.46 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  31.73 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  33.46 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  32.34 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  33.46 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  30.36 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.25 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.33 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  32.34 
 
 
300 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  31.72 
 
 
283 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  30.27 
 
 
304 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  32.73 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  31.79 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  32.52 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  35.64 
 
 
310 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  32.1 
 
 
307 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.17 
 
 
304 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.34 
 
 
290 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
304 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  35.64 
 
 
310 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
304 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  33.95 
 
 
301 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  29.49 
 
 
305 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  31.93 
 
 
307 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  29.67 
 
 
260 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 
287 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  32.72 
 
 
307 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0961  catechol dioxygenase domain protein  44.9 
 
 
167 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.378182 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  30.22 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  32.1 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  32.25 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  31.39 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  29 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  30.22 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  31.72 
 
 
287 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>