214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62287 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  100 
 
 
328 aa  676    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  53.4 
 
 
329 aa  354  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  48.9 
 
 
334 aa  322  6e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  48.16 
 
 
276 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  44.19 
 
 
289 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  46.22 
 
 
290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  44.92 
 
 
301 aa  241  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.8 
 
 
287 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.79 
 
 
293 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  44.22 
 
 
287 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  41.07 
 
 
279 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  43.92 
 
 
306 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  46.09 
 
 
278 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.05 
 
 
294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  44.4 
 
 
293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.08 
 
 
283 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  41.49 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.24 
 
 
308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.21 
 
 
295 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.31 
 
 
300 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.57 
 
 
293 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  43.43 
 
 
302 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.85 
 
 
287 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  44.98 
 
 
299 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  41.6 
 
 
303 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.23 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.21 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.77 
 
 
304 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.26 
 
 
290 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.7 
 
 
309 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.26 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.65 
 
 
290 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.44 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  41.63 
 
 
296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  38.73 
 
 
296 aa  205  9e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  35.89 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  34.9 
 
 
306 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  36.13 
 
 
311 aa  192  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  34.46 
 
 
307 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  35.79 
 
 
297 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.97 
 
 
312 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.6 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.79 
 
 
287 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.06 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.14 
 
 
300 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.25 
 
 
296 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.27 
 
 
312 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  36.47 
 
 
297 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.72 
 
 
297 aa  175  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.2 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  38.33 
 
 
313 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.6 
 
 
317 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.3 
 
 
275 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  28.57 
 
 
290 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  29.96 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  31.33 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  28.88 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  30 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  27.49 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  29.18 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  28.46 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  26.32 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  29.17 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  28.93 
 
 
304 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  26.25 
 
 
305 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  27.34 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  26.2 
 
 
300 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.06 
 
 
307 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  27.97 
 
 
297 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  28.8 
 
 
310 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  27.88 
 
 
313 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
300 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  26.2 
 
 
300 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  28.12 
 
 
311 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  28.21 
 
 
287 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  26.01 
 
 
300 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  26.64 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  27.78 
 
 
287 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  26.69 
 
 
308 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  27.78 
 
 
287 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  28.29 
 
 
309 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  29.88 
 
 
311 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  27.96 
 
 
314 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.92 
 
 
307 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  27.55 
 
 
311 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  27.14 
 
 
302 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  26.97 
 
 
311 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 
300 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  27.55 
 
 
311 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  27.57 
 
 
317 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 
304 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 
304 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 
300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 
300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 
300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 
300 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  25.09 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  27.66 
 
 
316 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  27.04 
 
 
287 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>