245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2055 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 311 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  98.39 
 
 		 311 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  95.18 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  77.88 
 
 		 308 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  77.64 
 
 		 304 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  76.28 
 
 		 304 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  75.32 
 
 		 304 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  76.28 
 
 		 304 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  75.64 
 
 		 304 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  75.81 
 
 		 310 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  74.84 
 
 		 310 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  70.55 
 
 		 301 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  58.31 
 
 		 305 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  58.53 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  58.09 
 
 		 313 aa  358  9e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  55.89 
 
 		 305 aa  338  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  57.19 
 
 		 302 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  56.52 
 
 		 302 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  54.05 
 
 		 305 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  53.18 
 
 		 304 aa  319  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  51.79 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  56.34 
 
 		 307 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  51.18 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  55.08 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  51.13 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  51.13 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  50.65 
 
 		 310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  54.23 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  54.23 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  54.23 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  54.23 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  54.23 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  54.58 
 
 		 300 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  55.26 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  54.58 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  54.58 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  53.9 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  53.9 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  53.9 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  53.55 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  53.9 
 
 		 300 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  52.84 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  52.48 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  48.24 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50 
 
 		 307 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  47.6 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.66 
 
 		 307 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.06 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.23 
 
 		 298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  48.08 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  48.08 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  48.71 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  49.68 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  49.2 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.4 
 
 		 304 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  49.2 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  48.99 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  31.69 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.56 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.93 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.22 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.46 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  30.26 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  32.35 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  35.02 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.22 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.71 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  33.57 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.95 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.95 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  33.86 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  32.41 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.82 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  34.15 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.67 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.1 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  32.32 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  31.62 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  34.5 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.18 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.36 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.37 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.91 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.4 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.36 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  30.18 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.14 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.22 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.58 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.5 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  31.02 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  28.31 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.67 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  31.76 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  40.62 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>