222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2549 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  98.68 
 
 		 304 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  91.12 
 
 		 304 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  90.1 
 
 		 304 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  81.82 
 
 		 308 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  81.91 
 
 		 304 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  77.56 
 
 		 311 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  76.92 
 
 		 311 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  76.28 
 
 		 311 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  73.03 
 
 		 301 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  69.87 
 
 		 310 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  69.23 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  57.38 
 
 		 313 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  55.84 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  52.96 
 
 		 305 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  55.48 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  54.77 
 
 		 305 aa  311  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  56.14 
 
 		 302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  56.54 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  53.9 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  49.35 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  50 
 
 		 311 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  53.67 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  49.68 
 
 		 308 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  50.83 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  53.55 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  52.48 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  52.48 
 
 		 304 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  52.48 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  52.46 
 
 		 300 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  52.46 
 
 		 300 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  52.46 
 
 		 300 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  52.46 
 
 		 300 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  55.09 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  52.67 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  51.42 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  51.96 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  54.72 
 
 		 300 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.14 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  54.72 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  51.77 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  54.72 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.66 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.32 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  51.06 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  47.44 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.67 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  51.42 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  47.12 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.62 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  49.68 
 
 		 311 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  48.89 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  48.11 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  47.19 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  47.19 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  47.81 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  46.98 
 
 		 314 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  32.26 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.59 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.76 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.86 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  32.84 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.52 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.52 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.03 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  32.98 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  31.63 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  34.98 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  30.11 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  31.01 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  31.5 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.52 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.8 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.29 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.09 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.85 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.39 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  30.8 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.35 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.8 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  30.94 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.45 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.56 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.4 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.96 
 
 		 296 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.22 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.8 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  28.89 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.91 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.79 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.8 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  31.02 
 
 		 290 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.43 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  28.68 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  30.22 
 
 		 279 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  33.08 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>