237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4961 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  90.67 
 
 
300 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  90 
 
 
300 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  89.67 
 
 
300 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  90.3 
 
 
300 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  89.33 
 
 
300 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  89.67 
 
 
300 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  87.96 
 
 
300 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  89 
 
 
304 aa  550  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  89 
 
 
304 aa  550  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  89.56 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  88.67 
 
 
300 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  89.56 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  89.56 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  89.56 
 
 
300 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  78.67 
 
 
302 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  79 
 
 
302 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  73.67 
 
 
300 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  62.38 
 
 
305 aa  384  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  63.04 
 
 
305 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  61.39 
 
 
304 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  60.66 
 
 
307 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  56.35 
 
 
307 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  58.36 
 
 
307 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  56.95 
 
 
310 aa  329  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  56.23 
 
 
308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  55.7 
 
 
313 aa  324  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  56.43 
 
 
309 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  55.48 
 
 
312 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  53.52 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.97 
 
 
304 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  54.26 
 
 
311 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  53.49 
 
 
311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  53.55 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.96 
 
 
307 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.96 
 
 
307 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  58.11 
 
 
310 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  58.11 
 
 
310 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  50.17 
 
 
311 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  49.67 
 
 
311 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.17 
 
 
304 aa  291  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  53.93 
 
 
301 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  50.51 
 
 
304 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.82 
 
 
308 aa  285  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  51.06 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  47.16 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  48.99 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  51.42 
 
 
304 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  51.08 
 
 
304 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  48.37 
 
 
317 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  48.18 
 
 
314 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  51.47 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  51.47 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  49.32 
 
 
311 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  47.85 
 
 
314 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  47.7 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50 
 
 
298 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.19 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.56 
 
 
290 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.28 
 
 
309 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.85 
 
 
296 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  34.72 
 
 
307 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.58 
 
 
295 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.64 
 
 
312 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.82 
 
 
296 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.11 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.7 
 
 
275 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  33.88 
 
 
290 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  34.96 
 
 
297 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.47 
 
 
308 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.59 
 
 
294 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.14 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.58 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.73 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.51 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.34 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.55 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  33.06 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.8 
 
 
300 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  30.91 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  29.63 
 
 
306 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.2 
 
 
289 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  31.85 
 
 
278 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.11 
 
 
300 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.97 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  28.96 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.19 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.24 
 
 
297 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  32.54 
 
 
295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  31.34 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  33.48 
 
 
255 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.08 
 
 
306 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.21 
 
 
301 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  29.68 
 
 
303 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  28.77 
 
 
293 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  32.78 
 
 
287 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  36.55 
 
 
287 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>