222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1587 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  71.27 
 
 
279 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  63.41 
 
 
287 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  64.21 
 
 
290 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  61.32 
 
 
289 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.28 
 
 
293 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  59.72 
 
 
308 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.48 
 
 
294 aa  351  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  61.19 
 
 
287 aa  351  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  59.51 
 
 
301 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  57.09 
 
 
293 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.45 
 
 
300 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.64 
 
 
287 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51.26 
 
 
283 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  49.46 
 
 
278 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.7 
 
 
297 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.58 
 
 
303 aa  275  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.88 
 
 
293 aa  275  8e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 
304 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.52 
 
 
290 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.52 
 
 
290 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.52 
 
 
301 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.62 
 
 
295 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  50.76 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51.91 
 
 
299 aa  265  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.72 
 
 
309 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.19 
 
 
301 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  49.46 
 
 
296 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  49.43 
 
 
306 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.69 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  48.16 
 
 
328 aa  251  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  45.39 
 
 
306 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  46.27 
 
 
329 aa  247  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  45.3 
 
 
303 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.35 
 
 
296 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  42.05 
 
 
334 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.19 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  41.28 
 
 
307 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.59 
 
 
287 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.97 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.02 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.28 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.2 
 
 
288 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.79 
 
 
297 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.3 
 
 
297 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  39.62 
 
 
295 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  39.45 
 
 
297 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.93 
 
 
296 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  38.43 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  33.58 
 
 
311 aa  177  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.88 
 
 
317 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  36.02 
 
 
313 aa  170  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.43 
 
 
275 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.41 
 
 
255 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  33.83 
 
 
287 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  32.89 
 
 
308 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  33.93 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
304 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  33.72 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  33.83 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  31.75 
 
 
260 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.76 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  33.56 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  32.03 
 
 
283 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  33.2 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  33.09 
 
 
309 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  30.63 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  32.48 
 
 
287 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  32.64 
 
 
311 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.06 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  32.62 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  32.36 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  32.36 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  34.89 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  32.76 
 
 
311 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.56 
 
 
307 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  32.27 
 
 
302 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 
313 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.27 
 
 
304 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  31.84 
 
 
310 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  32.34 
 
 
316 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  32.34 
 
 
316 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  32.36 
 
 
316 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  32.42 
 
 
311 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.56 
 
 
307 aa  122  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  31.34 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  31.01 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  32.72 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  32.09 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  32.09 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  29.57 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  31.34 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 
317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  32.09 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  32.09 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>