222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6138 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  63.29 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  63.51 
 
 		 279 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  63.38 
 
 		 287 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  61.19 
 
 		 276 aa  351  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.21 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.21 
 
 		 293 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  61.19 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  59.15 
 
 		 301 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  58.48 
 
 		 293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.04 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  51.57 
 
 		 306 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.31 
 
 		 297 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.12 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  48.18 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.52 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  50.17 
 
 		 302 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  51.22 
 
 		 303 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  50.53 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.94 
 
 		 303 aa  279  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.06 
 
 		 304 aa  278  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.1 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.21 
 
 		 293 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  46.29 
 
 		 329 aa  271  9e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  48.64 
 
 		 334 aa  263  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  50.36 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.51 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.91 
 
 		 290 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.12 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51.61 
 
 		 283 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.1 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  49.03 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.1 
 
 		 312 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  48.97 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  42.8 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  44.52 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.79 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.4 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.91 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.91 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.65 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.91 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.45 
 
 		 287 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  39.86 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.65 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  37.07 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  36.72 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  36.44 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  37.16 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  31.23 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.45 
 
 		 255 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  30.45 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  35.6 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  33 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  32.33 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  31.71 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  34.87 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  32.97 
 
 		 311 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  32.99 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  32.73 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.74 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0961  catechol dioxygenase domain protein  41.67 
 
 		 167 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.378182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  33.62 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  32.18 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  34.81 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  29.6 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  32.97 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  34.14 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  34.14 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  30.97 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  30.26 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  31.6 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  29.07 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  30.97 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  31.14 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.59 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  32.12 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  30.6 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  31.93 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  31.75 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.03 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  30.6 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>