91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3523 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.49 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.1 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.11 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  47.13 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.68 
 
 		 256 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.63 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.37 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.69 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.08 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  47.39 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.3 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.36 
 
 		 281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.28 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.24 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.72 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  42.31 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  33.33 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.1 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.02 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.75 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  34.3 
 
 		 377 aa  108  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  35.87 
 
 		 383 aa  108  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.71 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.36 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.08 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.7 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.18 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.42 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.54 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  32.79 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  29.75 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.64 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  95.9  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.72 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  33.15 
 
 		 376 aa  92.4  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.26 
 
 		 308 aa  89.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  29.75 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.02 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.55 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.18 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.96 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.22 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.85 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.58 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.08 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.48 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  35.11 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.29 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.29 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.57 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.11 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.33 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.29 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.4 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  36.27 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  29.14 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  26 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  30.77 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2387  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.18 
 
 		 241 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.581164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.81 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  27.81 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  28.19 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  32.22 
 
 		 190 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.06 
 
 		 228 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0615  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.56 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  25.83 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  28.33 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  28.33 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02907  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  32.71 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  28.57 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  28.33 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  30.39 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7609  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.65 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  27.69 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0643  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.99 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.599844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1073  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.83 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5085  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  24.73 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  25.32 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  35.24 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.03 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.43 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0627  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.41 
 
 		 237 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.799522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>