176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0945 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  69.1 
 
 
299 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  66.16 
 
 
237 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.56 
 
 
282 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50 
 
 
256 aa  265  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  47.14 
 
 
252 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.48 
 
 
288 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  56.31 
 
 
245 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.04 
 
 
234 aa  236  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  54.22 
 
 
252 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.79 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.43 
 
 
233 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.81 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  47.02 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  35.08 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.08 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  35.08 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.31 
 
 
266 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.84 
 
 
236 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.78 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.57 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.13 
 
 
281 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.96 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.45 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.36 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.3 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.95 
 
 
238 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.68 
 
 
277 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 
383 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  34.47 
 
 
294 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.43 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.89 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  29.52 
 
 
377 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.43 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.68 
 
 
304 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.51 
 
 
318 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.95 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 
343 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.49 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.82 
 
 
343 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.36 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  30.56 
 
 
376 aa  85.5  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  31.32 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.95 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 
327 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.92 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  37.09 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.82 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  32.11 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.17 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.74 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.99 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 
280 aa  62.4  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.73 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.5 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.23 
 
 
193 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1859  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.65 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4195  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.65 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4059  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.55 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622543  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3579  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.55 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195352  normal  0.218152 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4172  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.65 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4419  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.65 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35064  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3345  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.65 
 
 
235 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2501  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.89 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0981  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.11 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00626299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.77 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.11 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2387  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.43 
 
 
241 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.581164  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0394  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.11 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0245  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.11 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000128841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1845  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.11 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0795201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.11 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00117633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1351  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.11 
 
 
244 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.010139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2186  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.98 
 
 
248 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.71 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.42 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3889  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.57 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  32.54 
 
 
190 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  29.36 
 
 
224 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.65 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2086  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  31.73 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.26 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1119  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.03 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00412306  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  28.47 
 
 
190 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  29.68 
 
 
223 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1382  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.49 
 
 
249 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.789862  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1441  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta oxidoreductase protein  29.49 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  34.16 
 
 
287 aa  52.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  30.06 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.88 
 
 
190 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0627  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.68 
 
 
237 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.799522  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  26.11 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.85 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00387688  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.85 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321116  normal  0.293575 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0643  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.33 
 
 
224 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.599844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4163  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.37 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2775  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit(PcaH)  31.85 
 
 
234 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000406236  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.41 
 
 
317 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  29.81 
 
 
213 aa  49.3  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>