227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2843 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.02 
 
 
309 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.16 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.53 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.15 
 
 
248 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.67 
 
 
299 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.81 
 
 
237 aa  145  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  49.37 
 
 
238 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  36.21 
 
 
252 aa  141  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.43 
 
 
288 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.17 
 
 
234 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.03 
 
 
281 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.62 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  38.86 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.2 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  34.71 
 
 
318 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.11 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.94 
 
 
238 aa  128  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.1 
 
 
244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.11 
 
 
250 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.33 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.87 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  36.36 
 
 
377 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.15 
 
 
258 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.76 
 
 
237 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.5 
 
 
258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  34.41 
 
 
383 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.7 
 
 
236 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.08 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  32.08 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  36.59 
 
 
343 aa  108  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  32.08 
 
 
277 aa  109  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.72 
 
 
311 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  35.56 
 
 
376 aa  108  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.03 
 
 
318 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.14 
 
 
310 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.18 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  38.62 
 
 
349 aa  94  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  43.9 
 
 
277 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  32.04 
 
 
294 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  37.57 
 
 
396 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.38 
 
 
192 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.93 
 
 
325 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.09 
 
 
308 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.26 
 
 
313 aa  88.6  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.13 
 
 
331 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.41 
 
 
303 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  31.38 
 
 
327 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
328 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.44 
 
 
343 aa  85.9  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.18 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.45 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  35.16 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.01 
 
 
193 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  40.43 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  31.65 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.76 
 
 
191 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.55 
 
 
228 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.52 
 
 
190 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.8 
 
 
271 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.69 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  30.57 
 
 
297 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.97 
 
 
290 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.94 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.36 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  30.29 
 
 
312 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32 
 
 
297 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.29 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.78 
 
 
301 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.59 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.64 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
301 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  28.87 
 
 
307 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  27.78 
 
 
283 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  32.89 
 
 
305 aa  55.5  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.81 
 
 
290 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2326  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  36 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
233 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.81 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1309  hypothetical protein  38.46 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1538  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.18 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0431142  normal  0.14512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2835  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  31.33 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204009  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.28 
 
 
309 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  26.26 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1073  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.4 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.08 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  29.07 
 
 
300 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  29.25 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  28.23 
 
 
311 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.25 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
311 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  27.85 
 
 
311 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.27 
 
 
308 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2186  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.54 
 
 
248 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  29.88 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.43 
 
 
317 aa  52.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.05 
 
 
303 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>