86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3212 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.59 
 
 		 288 aa  241  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.22 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.78 
 
 		 234 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  46.99 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.14 
 
 		 299 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.14 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.15 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.86 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.15 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  44.81 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.82 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.92 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  41.07 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.55 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  33.97 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  33.97 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.97 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.37 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.98 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.16 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.87 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.44 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.58 
 
 		 311 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.67 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.54 
 
 		 318 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.8 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  29.55 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  34.22 
 
 		 377 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  28.8 
 
 		 376 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  34.21 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.98 
 
 		 313 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.16 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.87 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.05 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  29.29 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.09 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.97 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.85 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.69 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.02 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.25 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  28.43 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.01 
 
 		 323 aa  79  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.05 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.65 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  39.23 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.52 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.35 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.58 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  36.27 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.3 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.03 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.89 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.11 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.14 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.79 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  40 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  28.95 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  27.89 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.34 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0643  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.48 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.599844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  33.65 
 
 		 311 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  33.65 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  34.83 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  32.33 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.66 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  32.69 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  33.65 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  32.69 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3727  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.56 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  32.38 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 311 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  23.57 
 
 		 224 aa  42  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  44.44 
 
 		 313 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  31.93 
 
 		 260 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.36 
 
 		 290 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0645  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.86 
 
 		 246 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.88521  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 		 311 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 		 311 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>