166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3769 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
237 aa  490  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  61.6 
 
 
250 aa  301  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.83 
 
 
236 aa  267  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.67 
 
 
244 aa  185  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.36 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.63 
 
 
248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.44 
 
 
304 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.62 
 
 
281 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.56 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.82 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.57 
 
 
288 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  33.33 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.95 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  33.04 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.24 
 
 
282 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.5 
 
 
303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.76 
 
 
233 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36 
 
 
311 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.95 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.49 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.45 
 
 
319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.5 
 
 
308 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.41 
 
 
277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.93 
 
 
343 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.16 
 
 
309 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  35.55 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.64 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.62 
 
 
266 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.48 
 
 
288 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  35.03 
 
 
252 aa  108  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  33.16 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
256 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.48 
 
 
310 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.68 
 
 
245 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.78 
 
 
323 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.67 
 
 
237 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  34.67 
 
 
294 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  32.85 
 
 
377 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.8 
 
 
325 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  32.86 
 
 
349 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.71 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.46 
 
 
258 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.5 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  30.6 
 
 
383 aa  89.4  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  30.32 
 
 
376 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  85.5  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  33.9 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  34.59 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.73 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.72 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2835  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  29.79 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204009  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.27 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
280 aa  59.7  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1270  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.14 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5085  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.23 
 
 
238 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.09 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3345  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.5 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000710276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.33 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4890  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.79 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833858  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.08 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1581  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.87 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1073  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.23 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804087  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.08 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0558  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.82 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0665673  normal  0.206378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  27.74 
 
 
297 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  30.53 
 
 
190 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.78 
 
 
242 aa  52  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  29.27 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13010  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  25.35 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2186  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  25.83 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7609  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  26.24 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.06 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2693  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  29.05 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00265735  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.03 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3727  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.47 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5941  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.78 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1538  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.67 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0431142  normal  0.14512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.69 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  29.31 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  28.91 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  28.91 
 
 
287 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7079  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.47 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0898388  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  28.91 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2326  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  27.87 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4078  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.8 
 
 
300 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0627  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.16 
 
 
237 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.799522  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  31.07 
 
 
287 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  26.7 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321116  normal  0.293575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1698  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.05 
 
 
395 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1726  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.27 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1742  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.27 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1676  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.05 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0530  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.27 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6128  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  28.47 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>