96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1895 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1895  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 176 aa  360  7.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.949343 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  33.54 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  33.12 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2003  hypothetical protein  35.21 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0975244 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  32.48 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.53 
 
 		 258 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  31.47 
 
 		 312 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3880  twin-arginine translocation pathway signal  32.59 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.55 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  31.91 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3398  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.06 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.22 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.97 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  28.47 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.63 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  31.21 
 
 		 316 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  31.91 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  31.91 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  33.93 
 
 		 277 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  31.21 
 
 		 307 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  31.16 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.91 
 
 		 312 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.93 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  30.5 
 
 		 317 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  28.49 
 
 		 260 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  30.43 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  30.5 
 
 		 314 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  30.14 
 
 		 311 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.19 
 
 		 288 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  27.59 
 
 		 283 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  28.1 
 
 		 307 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  27.86 
 
 		 253 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  29.08 
 
 		 311 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  27.56 
 
 		 310 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.37 
 
 		 287 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.45 
 
 		 307 aa  48.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.49 
 
 		 304 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.09 
 
 		 216 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.01 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  29.75 
 
 		 307 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  28.36 
 
 		 311 aa  47.8  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.08 
 
 		 307 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.39 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  27.75 
 
 		 299 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  29.71 
 
 		 305 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  30.3 
 
 		 305 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  26.87 
 
 		 307 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  27.66 
 
 		 311 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  28.37 
 
 		 311 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.85 
 
 		 287 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 		 311 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  27.66 
 
 		 311 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  29.71 
 
 		 311 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  24.53 
 
 		 313 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  29.03 
 
 		 304 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  26.53 
 
 		 304 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 		 310 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.81 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.08 
 
 		 234 aa  44.7  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  26.53 
 
 		 304 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  29.36 
 
 		 300 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  29.71 
 
 		 310 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  29.5 
 
 		 300 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.14 
 
 		 266 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  30.28 
 
 		 300 aa  44.3  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  28.89 
 
 		 283 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.32 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.92 
 
 		 304 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.34 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  27.33 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  27.61 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  27.54 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  27.33 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  26.06 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.06 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.07 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.45 
 
 		 233 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  30.11 
 
 		 304 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.79 
 
 		 311 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  27.11 
 
 		 306 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  26.71 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  27.33 
 
 		 287 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.67 
 
 		 295 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  33.64 
 
 		 237 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  27.54 
 
 		 302 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.57 
 
 		 308 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.71 
 
 		 300 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  27.62 
 
 		 213 aa  40.8  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  25.68 
 
 		 304 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>