141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7908 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  49.5 
 
 
307 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  47.53 
 
 
391 aa  188  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  46 
 
 
390 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  52.06 
 
 
389 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  52.08 
 
 
388 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  46.67 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  36.97 
 
 
393 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  44.93 
 
 
372 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  40.18 
 
 
359 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  44.06 
 
 
358 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 
438 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.82 
 
 
429 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  41.58 
 
 
360 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  35.96 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  37.05 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  38 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  34.98 
 
 
443 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  35.83 
 
 
389 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  33.22 
 
 
338 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  29.93 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  34.04 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  34.78 
 
 
392 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  31.71 
 
 
402 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  34.72 
 
 
222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  30.7 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  31.82 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  31.74 
 
 
395 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  35.5 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
244 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  33.64 
 
 
365 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  33.64 
 
 
365 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  33.64 
 
 
378 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  33.64 
 
 
365 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  33.18 
 
 
197 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  33.64 
 
 
417 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  33.64 
 
 
408 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  33.64 
 
 
408 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  33.18 
 
 
449 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  34.31 
 
 
497 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  36.46 
 
 
251 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  33.02 
 
 
235 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  29.49 
 
 
534 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  29.49 
 
 
534 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  29.49 
 
 
534 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  33.97 
 
 
201 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  35.2 
 
 
201 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  31.42 
 
 
368 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  31.1 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  36.36 
 
 
212 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.18 
 
 
471 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  29.71 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.76 
 
 
477 aa  89.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  32.88 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  28.7 
 
 
405 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  29.33 
 
 
362 aa  86.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.02 
 
 
456 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  31.58 
 
 
436 aa  85.5  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  28.81 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  31.94 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  32.84 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.41 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  29.72 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31.9 
 
 
458 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  29.72 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.56 
 
 
455 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.02 
 
 
455 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  29.25 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  29.25 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  29.25 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  29.25 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  29.25 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.41 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  32.09 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  29.25 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  32.41 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.41 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  29.38 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  56.58 
 
 
904 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.63 
 
 
456 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.63 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.63 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  32.37 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  32.37 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  29.72 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.23 
 
 
497 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.22 
 
 
491 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  72.73 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  26.98 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  61.22 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.98 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.3 
 
 
473 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  29.67 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  30.85 
 
 
458 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  28.62 
 
 
651 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  29.06 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  26.83 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  68.42 
 
 
1077 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.85 
 
 
481 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  66.67 
 
 
551 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>