125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0217 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  100 
 
 		 395 aa  821    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  66.33 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  63.89 
 
 		 392 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  43.12 
 
 		 497 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  35.51 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  35.51 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  35.51 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  35.51 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  36.83 
 
 		 534 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  36.83 
 
 		 534 aa  179  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  36.83 
 
 		 534 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 449 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  30.23 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  30.54 
 
 		 390 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  28.32 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  31.99 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  29.36 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  30.48 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.75 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  32.46 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  25.81 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  31.86 
 
 		 360 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  32.41 
 
 		 438 aa  89.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  29.92 
 
 		 347 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  31.28 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  30.24 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  33.17 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  30 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  32.37 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  28 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  27.91 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  60.98 
 
 		 729 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  60.98 
 
 		 729 aa  63.5  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  55.81 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  31.58 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  54.55 
 
 		 855 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.33 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.33 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.33 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.58 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  56.1 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  56.1 
 
 		 772 aa  59.7  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.1 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.1 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.85 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  51.16 
 
 		 848 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.85 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  28.37 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  25.52 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  29.2 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  54.55 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  25 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  28.8 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  28.8 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.06 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  50 
 
 		 848 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  26.01 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  24.88 
 
 		 220 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  25.52 
 
 		 456 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  31.88 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 459 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  25.21 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  24.82 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.96 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  35.71 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  29.01 
 
 		 647 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  24.53 
 
 		 221 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.3 
 
 		 491 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.83 
 
 		 486 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.42 
 
 		 471 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  25.89 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  25.89 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 458 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  44.19 
 
 		 699 aa  50.1  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  23.68 
 
 		 651 aa  50.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  25.69 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.1 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.38 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  25.69 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  24.88 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.38 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  25.23 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  25.23 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  25.23 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  31.54 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.46 
 
 		 481 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  25.23 
 
 		 221 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.64 
 
 		 491 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  26.92 
 
 		 201 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  34.38 
 
 		 1242 aa  47.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  54.05 
 
 		 863 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>