More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7565 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  721    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  60.47 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  60.42 
 
 
360 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  52.19 
 
 
347 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  57.7 
 
 
358 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  41.48 
 
 
354 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  52.54 
 
 
443 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  53.42 
 
 
306 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  63.58 
 
 
212 aa  226  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  38.89 
 
 
389 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  46.72 
 
 
307 aa  217  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  50.23 
 
 
438 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  50.21 
 
 
429 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  41.35 
 
 
378 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  38.64 
 
 
390 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  40.19 
 
 
285 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  40.39 
 
 
389 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  40.39 
 
 
388 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  36.84 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  33.8 
 
 
362 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  33.56 
 
 
393 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  51.11 
 
 
474 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  55.56 
 
 
456 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  57.58 
 
 
422 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  50.47 
 
 
847 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  34.88 
 
 
351 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  31.49 
 
 
368 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  30.13 
 
 
497 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  33.78 
 
 
235 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  32.89 
 
 
402 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  52.59 
 
 
702 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  32.14 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  55 
 
 
673 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.15 
 
 
437 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  32.14 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  32.14 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  32.14 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  32.14 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  32.14 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  32.14 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  32.74 
 
 
222 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  53.57 
 
 
773 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  31.7 
 
 
449 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  50 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  50 
 
 
448 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  34.51 
 
 
223 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  48.96 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  52.08 
 
 
593 aa  93.6  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  33.93 
 
 
201 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  50 
 
 
460 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  51.61 
 
 
460 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  30.36 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  32.31 
 
 
534 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  32.31 
 
 
534 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  32.31 
 
 
534 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 
1209 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  51 
 
 
763 aa  89.7  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  46.08 
 
 
451 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  50 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  31 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  47.52 
 
 
449 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  44.44 
 
 
925 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  47.42 
 
 
477 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  48.96 
 
 
678 aa  87  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  48.96 
 
 
656 aa  86.3  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  47.06 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  50 
 
 
906 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  45.54 
 
 
694 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  49 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  29.82 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  48.28 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  33.64 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.43 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  33.64 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.71 
 
 
486 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.96 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  35.83 
 
 
794 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.96 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  28.95 
 
 
395 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  32.02 
 
 
197 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  46.03 
 
 
942 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  33.96 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.96 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.96 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  45.54 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  46.15 
 
 
744 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.49 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  45.54 
 
 
978 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  44.05 
 
 
913 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.6 
 
 
609 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.33 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  41 
 
 
562 aa  79.7  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  51.81 
 
 
1137 aa  79.7  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  31.11 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  31.11 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  49.45 
 
 
393 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  48.42 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  40.74 
 
 
756 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  51.19 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  50.6 
 
 
1298 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>