146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1137 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  100 
 
 		 402 aa  837    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  67.09 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  64.8 
 
 		 392 aa  553  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  44.64 
 
 		 497 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  38.62 
 
 		 449 aa  203  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  38.74 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  38.74 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  38.62 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  38.62 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  38.74 
 
 		 365 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  38.74 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  38.32 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 534 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 534 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 534 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  36.29 
 
 		 276 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  30.77 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  33.1 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  33.33 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  33.09 
 
 		 389 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  31.71 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  31.71 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  33.62 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  35.68 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  27.3 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  32.02 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  33.49 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  33.49 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 360 aa  93.6  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 358 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  36.53 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  33.66 
 
 		 306 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  31.33 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  29.96 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  31.17 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.11 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  47.95 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  34.85 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  68.18 
 
 		 772 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  25.73 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  58.33 
 
 		 848 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  66.67 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  26.51 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  29.25 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  60.47 
 
 		 855 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  26.58 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  25.96 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  64.29 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  23.93 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  26.58 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  23.93 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  24.9 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  27.27 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  59.52 
 
 		 729 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  59.52 
 
 		 729 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  31.43 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  43.06 
 
 		 699 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  23.71 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  23.71 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  25.53 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  29.09 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  23.43 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  23.43 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  25.86 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  45.31 
 
 		 1242 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  26.46 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  50.91 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  26.61 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  26.61 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.6 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  25.46 
 
 		 221 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  51.16 
 
 		 848 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  53.85 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  26.13 
 
 		 201 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  25.46 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  25 
 
 		 458 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  25.46 
 
 		 221 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.47 
 
 		 477 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  25 
 
 		 221 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  25 
 
 		 221 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  25 
 
 		 221 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  25 
 
 		 221 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  25.82 
 
 		 201 aa  53.9  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  57.14 
 
 		 763 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  27.59 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  43.55 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  55.81 
 
 		 765 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  50 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>