49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3105 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  36.78 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  36.29 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  37.55 
 
 		 408 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  37.55 
 
 		 408 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  37.55 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  37.55 
 
 		 378 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  37.55 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  37.55 
 
 		 365 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  37.15 
 
 		 417 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  37.15 
 
 		 449 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  36.95 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  36.95 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  36.95 
 
 		 534 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  32 
 
 		 392 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  34.73 
 
 		 497 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  30.71 
 
 		 395 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  33.47 
 
 		 378 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  28.32 
 
 		 390 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.58 
 
 		 389 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  30.17 
 
 		 388 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  29.71 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  27.24 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  27.21 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  26.57 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  26.83 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  25.32 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  27.24 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  40 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  32.48 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  24.16 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  32.86 
 
 		 393 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  34.9 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  27.27 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  25.59 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  26.6 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  24.37 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  24.6 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  30 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  28.74 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  26.69 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  23.89 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  24.21 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  28.67 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  28.7 
 
 		 183 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  31.65 
 
 		 445 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  29.61 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  27.66 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>