101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2948 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 306 aa  621  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  59.73 
 
 		 443 aa  295  7e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  61.43 
 
 		 372 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  60.77 
 
 		 360 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  59.9 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  53.14 
 
 		 347 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  51.72 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  47.81 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  43.69 
 
 		 438 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  52.35 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  49.52 
 
 		 429 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  42.73 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  40.24 
 
 		 400 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  37.73 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  36.77 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  37.55 
 
 		 389 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  37.55 
 
 		 388 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  34.93 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  36.28 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  32.6 
 
 		 497 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  30.6 
 
 		 393 aa  93.2  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  33.33 
 
 		 402 aa  92.4  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  32.2 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  32.27 
 
 		 235 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  29.26 
 
 		 534 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  29.26 
 
 		 534 aa  86.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  29.26 
 
 		 534 aa  86.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  31.14 
 
 		 201 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  29.63 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  31.63 
 
 		 408 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  31.63 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  29.49 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  31.63 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  31.63 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  30.87 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  30.22 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  35.56 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  28.7 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  32 
 
 		 436 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  27.65 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  28.08 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  26.85 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  27.47 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  30 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  28.96 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  28.96 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  27.23 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  27.78 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  27.78 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  30 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.51 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  26.69 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  29.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  29.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  26.69 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  29.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  29.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  29.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  27.62 
 
 		 455 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  29.05 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  28.57 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.81 
 
 		 455 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  26.27 
 
 		 405 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.88 
 
 		 497 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  27.47 
 
 		 456 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.5 
 
 		 455 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  25.86 
 
 		 455 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  26.77 
 
 		 455 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  25.65 
 
 		 458 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  26.77 
 
 		 455 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  26.72 
 
 		 455 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  27.15 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  27.4 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  27.4 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 459 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.36 
 
 		 486 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  27.4 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  26.41 
 
 		 456 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  27.4 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  27.4 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  27.4 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.06 
 
 		 445 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.23 
 
 		 485 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.35 
 
 		 487 aa  45.8  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.23 
 
 		 477 aa  45.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  35.44 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  30.28 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.27 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 192 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.3 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  26.38 
 
 		 651 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  26.83 
 
 		 236 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>