158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2244 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 
351 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  60.6 
 
 
362 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  61.72 
 
 
235 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  55.56 
 
 
223 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  58.14 
 
 
222 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  55.5 
 
 
368 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  46.05 
 
 
220 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  34.43 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  31.37 
 
 
389 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  32.49 
 
 
372 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  30.03 
 
 
354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  35.38 
 
 
313 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  34.58 
 
 
443 aa  106  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  28.93 
 
 
347 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  32.24 
 
 
390 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  32.11 
 
 
307 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  35.76 
 
 
359 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.69 
 
 
389 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  30.69 
 
 
388 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  30.17 
 
 
360 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  29.76 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  30.74 
 
 
405 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  45.07 
 
 
468 aa  82  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  28.04 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  28.64 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  31.28 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  49.41 
 
 
900 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  48.35 
 
 
655 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  44.07 
 
 
846 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  29.63 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  43.75 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  27.43 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  45.56 
 
 
820 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  38.81 
 
 
756 aa  73.6  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  27.27 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  27.27 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  27.27 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  27.27 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  27.27 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  27.27 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  27.27 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  27.78 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  24.8 
 
 
534 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  24.8 
 
 
534 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  24.8 
 
 
534 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  37.72 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 
493 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  47.83 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  26.41 
 
 
449 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  39.36 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  24.12 
 
 
276 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  39.22 
 
 
449 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  41.46 
 
 
460 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  43.2 
 
 
474 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.32 
 
 
437 aa  63.2  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  40.71 
 
 
725 aa  62.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  30.77 
 
 
402 aa  62.8  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.48 
 
 
491 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  44.79 
 
 
456 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  29.02 
 
 
201 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  43.75 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  41.67 
 
 
457 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  40.4 
 
 
477 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  25.78 
 
 
356 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  36.5 
 
 
694 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  34.85 
 
 
792 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.58 
 
 
491 aa  60.1  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.38 
 
 
481 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  31.85 
 
 
545 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  26.92 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  41.94 
 
 
593 aa  59.7  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.38 
 
 
481 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.03 
 
 
491 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.38 
 
 
481 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  30.61 
 
 
392 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  37.8 
 
 
673 aa  59.3  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  28.19 
 
 
497 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  29.38 
 
 
201 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  36.17 
 
 
454 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  38.37 
 
 
459 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  39.76 
 
 
451 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
812 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  35.48 
 
 
702 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  37.5 
 
 
89 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  28.57 
 
 
395 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  48.15 
 
 
445 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  40.4 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  36.79 
 
 
658 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  39.32 
 
 
942 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  44.58 
 
 
467 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  34.38 
 
 
455 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  39.51 
 
 
532 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  42.27 
 
 
523 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.49 
 
 
481 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  36.27 
 
 
847 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  44.76 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  38.55 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  45.33 
 
 
787 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  26.67 
 
 
212 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>