126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0504 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 445 aa  878    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  52.73 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  48.44 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  51.16 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  51.49 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  46.07 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  58.23 
 
 		 523 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  57.24 
 
 		 543 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  50.88 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  50.16 
 
 		 561 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  48.85 
 
 		 1294 aa  292  9e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.51 
 
 		 507 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  51.65 
 
 		 1369 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  51.06 
 
 		 1414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  30.79 
 
 		 558 aa  136  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  28.17 
 
 		 732 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  51.55 
 
 		 900 aa  91.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  52.22 
 
 		 820 aa  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  28.09 
 
 		 850 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  53.33 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  47.66 
 
 		 655 aa  83.2  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  50 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  53.12 
 
 		 702 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  53.68 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  51.85 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  52.04 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  44.32 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  48.89 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  48.15 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  45.35 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  52.5 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  47.92 
 
 		 349 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  44.79 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.36 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  50.6 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  48.94 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.36 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  40.23 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  41.84 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4515  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  33.14 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  44.9 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  45.26 
 
 		 593 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  40.38 
 
 		 847 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  45.92 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  39.36 
 
 		 854 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  23.65 
 
 		 930 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  42.86 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  41.35 
 
 		 911 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  28.32 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  25.69 
 
 		 755 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  42.71 
 
 		 658 aa  57  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  47.3 
 
 		 725 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.82 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.14 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  40.45 
 
 		 649 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  43.88 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  23.47 
 
 		 505 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  23.29 
 
 		 505 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  40 
 
 		 353 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  41.77 
 
 		 792 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  43.18 
 
 		 854 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  38.1 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2048  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.904754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  44.05 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.18 
 
 		 690 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  40 
 
 		 913 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  23.83 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  46.99 
 
 		 89 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  21.34 
 
 		 717 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  37.65 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.89 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  38.37 
 
 		 773 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  33.98 
 
 		 925 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.18 
 
 		 867 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  42 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  41.56 
 
 		 536 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  21.35 
 
 		 863 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  40.22 
 
 		 744 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.89 
 
 		 2305 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 459 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  40.51 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 678 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  35.92 
 
 		 2310 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  35.29 
 
 		 875 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  36.05 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  24.64 
 
 		 466 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  39.76 
 
 		 558 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  23.17 
 
 		 457 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  39.77 
 
 		 646 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  42.27 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  36.47 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 1209 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  20.2 
 
 		 322 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 358 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  37.21 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  36.84 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  37.21 
 
 		 656 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  38.37 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>