239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3558 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  81.9 
 
 
756 aa  667    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 
820 aa  1688    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  62.25 
 
 
815 aa  897    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  68.19 
 
 
474 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  64.4 
 
 
454 aa  502  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  70.08 
 
 
472 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  72.4 
 
 
497 aa  469  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  61.65 
 
 
451 aa  465  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  62.25 
 
 
1001 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  63.81 
 
 
457 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  60.38 
 
 
829 aa  459  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  70.07 
 
 
495 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  60.38 
 
 
370 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  49.64 
 
 
457 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46.29 
 
 
474 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  43.56 
 
 
488 aa  289  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  40.75 
 
 
503 aa  287  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.83 
 
 
491 aa  286  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  40.88 
 
 
451 aa  286  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  42.55 
 
 
490 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  43.68 
 
 
678 aa  270  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  40.22 
 
 
477 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.79 
 
 
778 aa  268  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.33 
 
 
487 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  45.63 
 
 
423 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  47.94 
 
 
543 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  41.84 
 
 
837 aa  250  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  43.79 
 
 
309 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  36.62 
 
 
628 aa  223  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.32 
 
 
333 aa  220  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  36.42 
 
 
347 aa  221  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  36 
 
 
347 aa  218  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  34.76 
 
 
371 aa  213  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  36.93 
 
 
389 aa  204  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  37.79 
 
 
366 aa  200  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  33.61 
 
 
373 aa  198  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  36.1 
 
 
323 aa  197  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  36.77 
 
 
375 aa  191  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  36.2 
 
 
328 aa  191  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  34.42 
 
 
399 aa  188  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  37.29 
 
 
324 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  34.01 
 
 
383 aa  187  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  33.53 
 
 
1037 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.15 
 
 
697 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  31.53 
 
 
689 aa  181  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  32.84 
 
 
394 aa  180  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  35.02 
 
 
376 aa  179  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  37.89 
 
 
317 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.98 
 
 
1041 aa  178  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.25 
 
 
1478 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  36.22 
 
 
321 aa  176  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  38.18 
 
 
619 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  33.91 
 
 
359 aa  174  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.12 
 
 
321 aa  172  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  32.57 
 
 
398 aa  171  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  33.54 
 
 
338 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  34.98 
 
 
463 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  32.54 
 
 
1059 aa  168  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  32.54 
 
 
1059 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.69 
 
 
423 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.24 
 
 
337 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  30.83 
 
 
369 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  34.44 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  33.85 
 
 
1050 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  33.13 
 
 
370 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  32.46 
 
 
374 aa  164  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  33.22 
 
 
331 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  32.34 
 
 
370 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.77 
 
 
1495 aa  161  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  27.91 
 
 
373 aa  161  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  34.6 
 
 
1019 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  32.23 
 
 
364 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.38 
 
 
357 aa  158  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  28.48 
 
 
486 aa  157  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  34.35 
 
 
1020 aa  156  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.36 
 
 
407 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.51 
 
 
770 aa  154  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  31.07 
 
 
388 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  35.69 
 
 
2457 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  30.28 
 
 
465 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.59 
 
 
392 aa  149  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  31.58 
 
 
756 aa  147  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  27.51 
 
 
806 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  32.59 
 
 
1077 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.43 
 
 
355 aa  140  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  32.99 
 
 
690 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  31.69 
 
 
520 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
619 aa  138  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.3 
 
 
382 aa  137  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  30.75 
 
 
1018 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  31.71 
 
 
357 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  30.19 
 
 
566 aa  134  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  31.17 
 
 
381 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  29.33 
 
 
387 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  31.14 
 
 
357 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 
639 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 
368 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  31.27 
 
 
561 aa  128  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.11 
 
 
912 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  31.31 
 
 
541 aa  124  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>