260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2590 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 639 aa  1316    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  57.22 
 
 		 760 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  32.02 
 
 		 674 aa  244  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 417 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  34.46 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 		 606 aa  170  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  30.17 
 
 		 670 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  28.14 
 
 		 1059 aa  166  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  28.14 
 
 		 1059 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  27.78 
 
 		 975 aa  161  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  28.77 
 
 		 831 aa  160  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  28.5 
 
 		 748 aa  150  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  29.29 
 
 		 434 aa  150  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  28.1 
 
 		 482 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  25.45 
 
 		 1018 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  26.67 
 
 		 1037 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  24.9 
 
 		 1019 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  25.74 
 
 		 912 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  25.25 
 
 		 1050 aa  137  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  26.17 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  28.23 
 
 		 1041 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  24.94 
 
 		 1186 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.15 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 837 aa  132  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  25.91 
 
 		 1020 aa  132  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  31.14 
 
 		 333 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.66 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  27.2 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  26.13 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 678 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  30.08 
 
 		 474 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  27.61 
 
 		 490 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  29.7 
 
 		 820 aa  126  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  30.08 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  28.62 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  30.48 
 
 		 491 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  27.01 
 
 		 477 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  29.32 
 
 		 756 aa  120  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  30.71 
 
 		 451 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  29.31 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  25.93 
 
 		 778 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  31.71 
 
 		 309 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 451 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  27.64 
 
 		 457 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.48 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  24.31 
 
 		 487 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.06 
 
 		 697 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  29.81 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  30.6 
 
 		 829 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  26.92 
 
 		 472 aa  111  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  24.72 
 
 		 1780 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  26.97 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  28.43 
 
 		 371 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  30.3 
 
 		 389 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  26.23 
 
 		 433 aa  108  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  23.73 
 
 		 1495 aa  108  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  25.33 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  27.55 
 
 		 503 aa  107  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  28.68 
 
 		 347 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  28.33 
 
 		 383 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  22.18 
 
 		 689 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  28.33 
 
 		 338 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  27.74 
 
 		 347 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  27.96 
 
 		 323 aa  105  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  37.74 
 
 		 955 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  27.31 
 
 		 815 aa  104  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  23.56 
 
 		 756 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  29.09 
 
 		 376 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  27.37 
 
 		 325 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  26.15 
 
 		 997 aa  100  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  27.72 
 
 		 370 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  22.7 
 
 		 690 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  25.96 
 
 		 1001 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 325 aa  98.2  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  24.05 
 
 		 1014 aa  97.4  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  27.86 
 
 		 1414 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  24.83 
 
 		 357 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  29.71 
 
 		 364 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  26.69 
 
 		 398 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  27.99 
 
 		 1247 aa  95.5  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 1077 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  23.81 
 
 		 488 aa  95.5  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  23.49 
 
 		 373 aa  94.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  27.82 
 
 		 399 aa  93.2  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  24.73 
 
 		 357 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  27.59 
 
 		 357 aa  92  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  25.16 
 
 		 486 aa  90.5  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  23.45 
 
 		 1215 aa  89.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  24.03 
 
 		 417 aa  89.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  29.3 
 
 		 543 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  27.42 
 
 		 366 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 		 368 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  26.96 
 
 		 370 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  28.36 
 
 		 387 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  25.85 
 
 		 388 aa  87  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 628 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  26.51 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  55.41 
 
 		 591 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>