129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01610 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  100 
 
 		 415 aa  826    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  56.01 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  55.38 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  52.99 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  50.51 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  44.22 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  41.38 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  25.98 
 
 		 674 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  26.23 
 
 		 498 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  30.17 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  28.48 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  29.9 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  27.42 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0323  glycoside hydrolase family 10  26.68 
 
 		 521 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 639 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0316  glycoside hydrolase family 10  28.14 
 
 		 521 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  27.58 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  30.35 
 
 		 333 aa  106  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  26.45 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  28.01 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  27.47 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  27.11 
 
 		 347 aa  100  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  28.47 
 
 		 383 aa  99.8  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  27.24 
 
 		 375 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  28.42 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  27.17 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  23.54 
 
 		 760 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  27.13 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 606 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 678 aa  93.6  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  24.38 
 
 		 820 aa  93.2  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  26.57 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  26.67 
 
 		 398 aa  93.2  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  23.27 
 
 		 975 aa  93.2  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  27.6 
 
 		 328 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  25.8 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  23.93 
 
 		 495 aa  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  24.91 
 
 		 477 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  24.81 
 
 		 815 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 837 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  24.38 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  24.19 
 
 		 748 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 		 628 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  24.77 
 
 		 490 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  27.98 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  24.49 
 
 		 778 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  27.36 
 
 		 1018 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  25.19 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  25.17 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  24.03 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  25.91 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  25.09 
 
 		 756 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  28.28 
 
 		 1020 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  26.39 
 
 		 689 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  28.36 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  24.5 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  23.67 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  26.35 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  26.72 
 
 		 1041 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  29.34 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  25.09 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  26.45 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  22.97 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  27.09 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  24.34 
 
 		 829 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  27 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  26.21 
 
 		 1059 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  26.21 
 
 		 1059 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  25.09 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  24.23 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  27.04 
 
 		 1037 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.28 
 
 		 697 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  25.1 
 
 		 1001 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.61 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 619 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  25.75 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  26.01 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  27.27 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  23.66 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  26.12 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  29.41 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  26.07 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  24.28 
 
 		 1478 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  25.08 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  22.4 
 
 		 831 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  27.49 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  24.34 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  22.42 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  25.51 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  27.07 
 
 		 770 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  27.4 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  23.06 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  25.84 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.24 
 
 		 1019 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  26.14 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>