125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0153 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 
428 aa  887    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  58.77 
 
 
408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  45.01 
 
 
433 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  45.72 
 
 
433 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  41.38 
 
 
415 aa  356  5e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  42.44 
 
 
399 aa  350  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  41.2 
 
 
417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  27.32 
 
 
674 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  23.82 
 
 
417 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  26.63 
 
 
498 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  30.17 
 
 
347 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  30.17 
 
 
347 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  25.96 
 
 
333 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  27.97 
 
 
366 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  27.08 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
678 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 
639 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.93 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  28.24 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  24.88 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  30.05 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0323  glycoside hydrolase family 10  25.71 
 
 
521 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  28.93 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
837 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  28.16 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  26.84 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  23.21 
 
 
670 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  22.82 
 
 
748 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0316  glycoside hydrolase family 10  25.14 
 
 
521 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  30.48 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  23.61 
 
 
820 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  29.27 
 
 
399 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  29.38 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  30.46 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  30.23 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  26.45 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  27.05 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  26.75 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  25.95 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  26.32 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  28 
 
 
359 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  27.13 
 
 
317 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  28.28 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  26.53 
 
 
1037 aa  76.6  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  26.97 
 
 
368 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  26.71 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  26.74 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  27.24 
 
 
689 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  22.25 
 
 
760 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  22.8 
 
 
975 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  21.78 
 
 
831 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  25.6 
 
 
815 aa  73.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  29.31 
 
 
829 aa  73.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  28.16 
 
 
1478 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  25.68 
 
 
778 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 
454 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  29.48 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  23.31 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  25.09 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  25.27 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  23.98 
 
 
574 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  26.59 
 
 
756 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  29.66 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  22.63 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 
628 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  30.92 
 
 
1041 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.61 
 
 
697 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  28.18 
 
 
1059 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  28.18 
 
 
1059 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.01 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  28 
 
 
491 aa  67.8  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  28.38 
 
 
357 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  24.86 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.81 
 
 
1146 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  26.59 
 
 
357 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  21.54 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  26.44 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  28 
 
 
1020 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  26.47 
 
 
1018 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  26.63 
 
 
486 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  23.83 
 
 
487 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  23.1 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  25.09 
 
 
474 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  23.86 
 
 
806 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  26.49 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  26.35 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  23.95 
 
 
451 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  26.14 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  24.06 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  24.71 
 
 
1001 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  30.94 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  25.74 
 
 
543 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  24.89 
 
 
373 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.21 
 
 
912 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  24.02 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  24.19 
 
 
321 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 
606 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  21.99 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>