296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2441 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 
474 aa  971    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  69.34 
 
 
820 aa  564  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  66.82 
 
 
756 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  61.84 
 
 
472 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  60.83 
 
 
451 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  59.4 
 
 
454 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  72.31 
 
 
497 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  57.92 
 
 
815 aa  467  9.999999999999999e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  73.62 
 
 
1001 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  58.06 
 
 
829 aa  451  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  65.27 
 
 
495 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  59.04 
 
 
457 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  49.02 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  58.81 
 
 
370 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  47.28 
 
 
474 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.83 
 
 
488 aa  301  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.98 
 
 
491 aa  296  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  40.77 
 
 
503 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  40.04 
 
 
451 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  45.82 
 
 
678 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  45.27 
 
 
490 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  38.13 
 
 
477 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 
487 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.69 
 
 
778 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  48.06 
 
 
543 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  40.17 
 
 
423 aa  251  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  43.6 
 
 
309 aa  248  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  40.22 
 
 
628 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 
837 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  38.22 
 
 
371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  37.69 
 
 
333 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  36.72 
 
 
347 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  37.75 
 
 
366 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  37.01 
 
 
347 aa  209  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  35.92 
 
 
389 aa  206  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  36.76 
 
 
323 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  38.02 
 
 
1037 aa  196  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  35.95 
 
 
373 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  35.67 
 
 
376 aa  192  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  38.12 
 
 
1050 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  37.85 
 
 
375 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  35.64 
 
 
383 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 
689 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  35.12 
 
 
394 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  35.37 
 
 
1041 aa  186  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  34.22 
 
 
399 aa  186  9e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  36.01 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  36.36 
 
 
1478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  34.97 
 
 
328 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.03 
 
 
697 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  35.51 
 
 
324 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  33.88 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  33.23 
 
 
321 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  35.12 
 
 
1495 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  36.46 
 
 
331 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  38.91 
 
 
619 aa  180  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  34.3 
 
 
423 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  35.22 
 
 
1059 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  35.22 
 
 
1059 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  38.24 
 
 
317 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  32.97 
 
 
463 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  33.13 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.56 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  35.08 
 
 
370 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  33.53 
 
 
1020 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  32.7 
 
 
374 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  33.99 
 
 
357 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 
407 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  32.73 
 
 
369 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  27.45 
 
 
373 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  36.13 
 
 
321 aa  165  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  34.67 
 
 
1019 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  34.26 
 
 
465 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  31.45 
 
 
401 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  35.37 
 
 
2457 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  33.85 
 
 
364 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  27.53 
 
 
486 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  34.23 
 
 
355 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 
1077 aa  156  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  32.81 
 
 
370 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  29.1 
 
 
806 aa  151  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  33.64 
 
 
690 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.75 
 
 
756 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  32.25 
 
 
520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  32.32 
 
 
388 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.31 
 
 
1018 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  33.01 
 
 
357 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.65 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.3 
 
 
770 aa  140  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  31.05 
 
 
912 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  30.67 
 
 
387 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  33.87 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  29.3 
 
 
639 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  32.29 
 
 
619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.98 
 
 
382 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  31.76 
 
 
381 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  32.92 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  32.52 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  32.41 
 
 
1331 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  31.6 
 
 
561 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>