More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0905 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 690 aa  1392    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  49.7 
 
 		 1019 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  40.78 
 
 		 912 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  41.18 
 
 		 1780 aa  349  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  40.72 
 
 		 1215 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  39.45 
 
 		 1331 aa  325  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  36.15 
 
 		 1037 aa  316  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.24 
 
 		 1146 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.11 
 
 		 1041 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  38.05 
 
 		 1018 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  31.87 
 
 		 1059 aa  283  9e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  31.87 
 
 		 1059 aa  283  9e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.4 
 
 		 697 aa  277  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  32.86 
 
 		 689 aa  271  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  32.95 
 
 		 1020 aa  264  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  33.2 
 
 		 1050 aa  246  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  32.45 
 
 		 1242 aa  234  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  33.93 
 
 		 488 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  32.45 
 
 		 491 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  35.81 
 
 		 1478 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  98.15 
 
 		 854 aa  221  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 619 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.52 
 
 		 1495 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  94.44 
 
 		 646 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 		 407 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  36.63 
 
 		 331 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  33.97 
 
 		 366 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  36.86 
 
 		 323 aa  195  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  35.26 
 
 		 337 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  34.69 
 
 		 321 aa  187  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  38.84 
 
 		 338 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  34.03 
 
 		 324 aa  183  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  31.52 
 
 		 829 aa  181  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  32.17 
 
 		 474 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  35.62 
 
 		 628 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  29.56 
 
 		 503 aa  177  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  32.31 
 
 		 756 aa  177  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  26.89 
 
 		 756 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  29.13 
 
 		 487 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  32.68 
 
 		 374 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  31.86 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  33.63 
 
 		 359 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  32.15 
 
 		 423 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  30.55 
 
 		 454 aa  160  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  29.98 
 
 		 815 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  36.73 
 
 		 474 aa  159  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 		 1077 aa  158  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  33.66 
 
 		 678 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  30.66 
 
 		 370 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  36.83 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.96 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  35.35 
 
 		 371 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  32.02 
 
 		 2457 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  34.31 
 
 		 328 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  33.23 
 
 		 423 aa  154  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 		 837 aa  150  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  32.58 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  26.96 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  32.07 
 
 		 778 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  29.46 
 
 		 451 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  34.55 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  30.97 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  32.48 
 
 		 619 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  32.86 
 
 		 389 aa  147  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  35.92 
 
 		 394 aa  147  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  35.12 
 
 		 333 aa  146  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  33.76 
 
 		 399 aa  146  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  29.84 
 
 		 1001 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  32.58 
 
 		 309 aa  144  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  36.07 
 
 		 543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  31.6 
 
 		 369 aa  141  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  32.2 
 
 		 820 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  31 
 
 		 347 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  30.67 
 
 		 347 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  35.55 
 
 		 388 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  34.66 
 
 		 497 aa  137  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  32.69 
 
 		 375 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  30.79 
 
 		 457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  61.17 
 
 		 990 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  31.48 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  28.54 
 
 		 451 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46.06 
 
 		 846 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  30.74 
 
 		 357 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  30.55 
 
 		 465 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  32.87 
 
 		 317 aa  125  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  55.77 
 
 		 597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  29.71 
 
 		 376 aa  120  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 		 368 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  35 
 
 		 370 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 		 398 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  27.35 
 
 		 364 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  55.88 
 
 		 767 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  28.82 
 
 		 373 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  48.15 
 
 		 942 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  30.25 
 
 		 401 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  29.6 
 
 		 370 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  51.89 
 
 		 623 aa  114  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  51.85 
 
 		 423 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  42.25 
 
 		 609 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  57.14 
 
 		 489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>