141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1647 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 323 aa  664    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  51.2 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  48.77 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  51.96 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  51.37 
 
 		 1037 aa  332  6e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  51.35 
 
 		 1478 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  51.39 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.39 
 
 		 697 aa  315  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  46.08 
 
 		 338 aa  315  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  45.83 
 
 		 689 aa  309  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  46.27 
 
 		 321 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  48.48 
 
 		 1041 aa  301  9e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  47.72 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  44.13 
 
 		 423 aa  297  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  49.25 
 
 		 1059 aa  295  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  49.25 
 
 		 1059 aa  295  5e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  46.85 
 
 		 1020 aa  276  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  39.82 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  39.82 
 
 		 382 aa  251  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  38.55 
 
 		 1019 aa  239  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  38.9 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  39.65 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  42.38 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  43.1 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  43.43 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  38.74 
 
 		 1018 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  41.21 
 
 		 371 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  39.3 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  40.86 
 
 		 837 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  42.6 
 
 		 399 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40.81 
 
 		 474 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  37.85 
 
 		 678 aa  222  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  35.99 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  37.54 
 
 		 1050 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  38.33 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  38.91 
 
 		 477 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  39.55 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  38.23 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  37.9 
 
 		 491 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  40.73 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  35.69 
 
 		 497 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  35.11 
 
 		 487 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  38.81 
 
 		 383 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  35.31 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  37.58 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  36.01 
 
 		 474 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  36.69 
 
 		 820 aa  198  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  35.6 
 
 		 815 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  38.38 
 
 		 488 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  36.86 
 
 		 690 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.58 
 
 		 495 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  34.82 
 
 		 912 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  36.99 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  36.98 
 
 		 457 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.44 
 
 		 778 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  36.01 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  33.96 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  33.69 
 
 		 756 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  35.26 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  37.84 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  34.05 
 
 		 806 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  39.34 
 
 		 503 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  34.85 
 
 		 756 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  36.74 
 
 		 543 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  35.69 
 
 		 829 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  34.19 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  35.02 
 
 		 465 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  34.81 
 
 		 1001 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.2 
 
 		 472 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  33.15 
 
 		 1495 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  33.56 
 
 		 628 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  33.97 
 
 		 619 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  35.55 
 
 		 2457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  33.75 
 
 		 486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  36.2 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  34.13 
 
 		 619 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  34.18 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  31.13 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  33.43 
 
 		 1780 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  36.67 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 1331 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.73 
 
 		 1146 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  32.85 
 
 		 401 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 		 1077 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  32.96 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  30.86 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  32.92 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  32.09 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  31.83 
 
 		 1215 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  33.02 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  32.49 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  31.15 
 
 		 770 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  31.38 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  27.33 
 
 		 520 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0809  glycoside hydrolase family 10  26.57 
 
 		 627 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>