More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2923 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  100 
 
 		 491 aa  1010    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  52.46 
 
 		 474 aa  448  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  51.55 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  48.36 
 
 		 488 aa  435  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  47.7 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  43.25 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  54.12 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  53.45 
 
 		 678 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  45.39 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  51.73 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  53.14 
 
 		 778 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  54.89 
 
 		 543 aa  332  8e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  45.81 
 
 		 373 aa  332  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  44.17 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  45.87 
 
 		 394 aa  299  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  50.42 
 
 		 495 aa  299  9e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  46.6 
 
 		 628 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  43 
 
 		 829 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  41.48 
 
 		 423 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  45.02 
 
 		 376 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  40.56 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  44.98 
 
 		 383 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  39.83 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  42.64 
 
 		 837 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  45.21 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  43.84 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  42.06 
 
 		 347 aa  279  9e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  40.79 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  41.47 
 
 		 347 aa  277  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  47.59 
 
 		 497 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  43.16 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  40.89 
 
 		 820 aa  269  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  40.49 
 
 		 756 aa  263  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  38.52 
 
 		 472 aa  261  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  40.42 
 
 		 815 aa  259  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  42.65 
 
 		 309 aa  254  3e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  42.86 
 
 		 375 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  46.32 
 
 		 1001 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  41.72 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  38.78 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  40.73 
 
 		 333 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  41.51 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  39.34 
 
 		 321 aa  223  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  38.53 
 
 		 370 aa  217  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  38.71 
 
 		 1037 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  38.44 
 
 		 1478 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.22 
 
 		 697 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  35.57 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  96.12 
 
 		 364 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  36.75 
 
 		 1019 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  37.9 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  35.43 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  38.85 
 
 		 1041 aa  197  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  37.16 
 
 		 331 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  37.06 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  39.27 
 
 		 338 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  34.99 
 
 		 689 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  38.44 
 
 		 370 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  32.6 
 
 		 486 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  35.03 
 
 		 407 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  34.21 
 
 		 355 aa  186  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  35.33 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  36.18 
 
 		 321 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  36.04 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  32.2 
 
 		 364 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  35.71 
 
 		 1018 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  39.1 
 
 		 619 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  32.52 
 
 		 387 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  33.62 
 
 		 1059 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  33.62 
 
 		 1059 aa  177  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  38.07 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  33.24 
 
 		 465 aa  177  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  35.83 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  31.65 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  35.64 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  36.24 
 
 		 337 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  35.56 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  33.43 
 
 		 381 aa  170  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  35.9 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  34.66 
 
 		 690 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  32.48 
 
 		 1050 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  32.19 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  32.02 
 
 		 619 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  31.23 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  35.25 
 
 		 388 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  34.47 
 
 		 1020 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.41 
 
 		 912 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  34.37 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.91 
 
 		 1146 aa  150  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.79 
 
 		 1495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  30.85 
 
 		 566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  31.56 
 
 		 770 aa  144  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  29.31 
 
 		 756 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 		 382 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  31.56 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1077 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  32.01 
 
 		 1331 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  31.14 
 
 		 357 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  30.5 
 
 		 806 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>