263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0931 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 423 aa  882    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  49.69 
 
 		 628 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  46.15 
 
 		 347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  45.56 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  48.36 
 
 		 543 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  40.9 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  48.01 
 
 		 474 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  42.31 
 
 		 503 aa  291  1e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  45.18 
 
 		 491 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  42.17 
 
 		 837 aa  285  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  40.52 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  42.17 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  42.5 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.92 
 
 		 490 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 678 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  39.64 
 
 		 487 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  42.47 
 
 		 778 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  40.8 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  47.77 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  43.19 
 
 		 495 aa  253  7e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  34.01 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  44.68 
 
 		 457 aa  249  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  46.2 
 
 		 820 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  45.66 
 
 		 756 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  40.83 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  38.69 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  41.36 
 
 		 829 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  40.71 
 
 		 474 aa  236  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  44.52 
 
 		 457 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  40.5 
 
 		 815 aa  231  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  34.69 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  37.99 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  43.26 
 
 		 1001 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  37.07 
 
 		 328 aa  224  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  37.09 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  40.43 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  34.4 
 
 		 389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  38.02 
 
 		 472 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  37.25 
 
 		 454 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  37 
 
 		 375 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  40.41 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  41.33 
 
 		 1478 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  37.5 
 
 		 323 aa  205  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  36.9 
 
 		 619 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  34.75 
 
 		 370 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  36.62 
 
 		 317 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  36.89 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  36.75 
 
 		 366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  33.25 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  36.03 
 
 		 689 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.61 
 
 		 697 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  36.33 
 
 		 1037 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  36.91 
 
 		 1041 aa  189  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  36.79 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  35.19 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  29.89 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  35.17 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  34.4 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  31.8 
 
 		 373 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  34.05 
 
 		 1059 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  34.32 
 
 		 1059 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.09 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  34.15 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  35.41 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  35.74 
 
 		 619 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  31.94 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  34.01 
 
 		 1018 aa  173  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.55 
 
 		 1019 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 		 770 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  32.1 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  32.57 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  30.65 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  31.13 
 
 		 387 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  31.8 
 
 		 1020 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.72 
 
 		 369 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.8 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  28.64 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.97 
 
 		 1050 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  28.69 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  30.85 
 
 		 337 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  32.99 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  30.27 
 
 		 465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  30.75 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  34.24 
 
 		 756 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  32.57 
 
 		 690 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  32.34 
 
 		 806 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  33.69 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  29.87 
 
 		 357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  29.39 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  27.67 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.65 
 
 		 1146 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  28.08 
 
 		 392 aa  136  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.5 
 
 		 912 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  27.62 
 
 		 561 aa  136  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  29.47 
 
 		 1495 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 		 1077 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 639 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  29.3 
 
 		 674 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>