144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2105 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2105  xylanase  100 
 
 		 674 aa  1411    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  32.02 
 
 		 639 aa  244  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  33.63 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 		 417 aa  197  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  34.45 
 
 		 606 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 760 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  33.08 
 
 		 670 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 451 aa  171  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  31.07 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  29.1 
 
 		 975 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  29.29 
 
 		 831 aa  153  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  29.5 
 
 		 748 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2172  glycoside hydrolase family 10  28.82 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  30.13 
 
 		 371 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2370  glycosy hydrolase family protein  27.17 
 
 		 457 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  31.15 
 
 		 477 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  29.74 
 
 		 347 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  30.07 
 
 		 347 aa  127  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  27.14 
 
 		 408 aa  126  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  29.3 
 
 		 423 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  29.87 
 
 		 383 aa  124  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  27.89 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  27.32 
 
 		 428 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  27.96 
 
 		 778 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 837 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  28.85 
 
 		 487 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  29.52 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  30.33 
 
 		 375 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  29.45 
 
 		 333 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  29.35 
 
 		 389 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  26.78 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 678 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  25.98 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  29.56 
 
 		 399 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  28.72 
 
 		 457 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  26.24 
 
 		 495 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  26.37 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  27.15 
 
 		 394 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  29.41 
 
 		 574 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  25.67 
 
 		 357 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  27.97 
 
 		 497 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  28.94 
 
 		 1247 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  27.94 
 
 		 1186 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  27.87 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  26.99 
 
 		 689 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  27.6 
 
 		 323 aa  107  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  25.98 
 
 		 829 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  28.85 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  25.39 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  25 
 
 		 399 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  28.04 
 
 		 1041 aa  104  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  26.09 
 
 		 331 aa  104  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  28.06 
 
 		 1037 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  28.15 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  25.75 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  25.48 
 
 		 417 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 628 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  28.28 
 
 		 541 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  29.97 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  26.52 
 
 		 756 aa  100  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  30.29 
 
 		 997 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 398 aa  100  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  26.79 
 
 		 820 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  24.92 
 
 		 376 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2369  glycosy hydrolase family protein  25.52 
 
 		 1014 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  24.55 
 
 		 357 aa  97.8  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  26.51 
 
 		 309 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  27.83 
 
 		 1414 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  25.57 
 
 		 370 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 		 721 aa  97.1  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  25.32 
 
 		 474 aa  97.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  27.81 
 
 		 324 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  27.81 
 
 		 1478 aa  96.3  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 		 368 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  27.53 
 
 		 317 aa  94.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  27.16 
 
 		 543 aa  94  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 325 aa  94  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  26.91 
 
 		 366 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  24.57 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  25.29 
 
 		 370 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  25.53 
 
 		 364 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  28.67 
 
 		 325 aa  92.8  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  26.84 
 
 		 401 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  25.56 
 
 		 451 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  26.65 
 
 		 369 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.85 
 
 		 697 aa  91.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  28.24 
 
 		 423 aa  90.9  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  25.32 
 
 		 338 aa  89.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  24.19 
 
 		 373 aa  89.7  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 454 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 		 388 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  24.71 
 
 		 472 aa  87.8  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  25.87 
 
 		 815 aa  87.8  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  26.73 
 
 		 912 aa  87  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  27.81 
 
 		 337 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  25.9 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  23.02 
 
 		 1059 aa  85.1  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  23.02 
 
 		 1059 aa  85.1  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  24.71 
 
 		 1001 aa  84.3  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  24.93 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>