150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0181 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  100 
 
 		 574 aa  1161    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  72.99 
 
 		 1186 aa  455  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  40.15 
 
 		 541 aa  292  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3590  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.013688  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  36.96 
 
 		 721 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  37.06 
 
 		 997 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  38.68 
 
 		 1414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03861  glycosyl hydrolase family 10  40.86 
 
 		 325 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  36.96 
 
 		 1247 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  65.77 
 
 		 933 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03863  glycosyl hydrolase family 10  36.36 
 
 		 271 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  29.31 
 
 		 639 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  31.72 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  31.03 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  33.07 
 
 		 491 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  30.65 
 
 		 347 aa  111  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  30.07 
 
 		 338 aa  110  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  31.05 
 
 		 347 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  29.41 
 
 		 674 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  31.34 
 
 		 497 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  31.47 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  31.78 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  30.71 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 417 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  31.37 
 
 		 820 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 678 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 628 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  30.28 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  32.35 
 
 		 474 aa  103  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  26.45 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 		 689 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.92 
 
 		 474 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  31.13 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  31.6 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3209  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 		 606 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.818517  normal  0.245162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.52 
 
 		 778 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2119  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 760 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  27.27 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  30.91 
 
 		 366 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.69 
 
 		 495 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  28.29 
 
 		 357 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  28.43 
 
 		 815 aa  97.8  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1074  glycoside hydrolase family 10  26.07 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  26.42 
 
 		 1059 aa  97.1  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  26.42 
 
 		 1059 aa  96.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  30.03 
 
 		 829 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  31.19 
 
 		 472 aa  95.9  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  28.26 
 
 		 321 aa  96.3  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0323  TonB-like  27.42 
 
 		 670 aa  94.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000416946  normal  0.597274 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  30.73 
 
 		 376 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  30.56 
 
 		 756 aa  94.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  66.67 
 
 		 451 aa  94.7  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  30.66 
 
 		 457 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  29.82 
 
 		 317 aa  94  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  27.92 
 
 		 1041 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  31.31 
 
 		 359 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  28.11 
 
 		 309 aa  91.3  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  27.91 
 
 		 357 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  28 
 
 		 1019 aa  91.3  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  29.8 
 
 		 454 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  27.83 
 
 		 1478 aa  90.5  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  29.25 
 
 		 912 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  29.08 
 
 		 1018 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 770 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  27.16 
 
 		 394 aa  88.6  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 		 324 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 837 aa  88.2  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.16 
 
 		 697 aa  87.4  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  24.38 
 
 		 806 aa  87  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  27.27 
 
 		 323 aa  87  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  29.41 
 
 		 388 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  28.72 
 
 		 1020 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  28.05 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 		 619 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  30.33 
 
 		 1037 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  25.59 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  28.42 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  26.79 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  27.56 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  29.39 
 
 		 1001 aa  84  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  30.05 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  29.39 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  31.07 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  31.94 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  24.51 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  29.46 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  30.46 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  55.56 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  29.78 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  24.85 
 
 		 756 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 1077 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  25.47 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  24.35 
 
 		 1050 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  28.82 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  27.38 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  25.26 
 
 		 690 aa  77  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>