57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1529 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  100 
 
 
426 aa  871    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  68.89 
 
 
451 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  54.17 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  67.88 
 
 
630 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  64.86 
 
 
638 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  51.1 
 
 
610 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  48.9 
 
 
346 aa  272  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  44 
 
 
1302 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  51.4 
 
 
1167 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  39.23 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  38.61 
 
 
505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  37.18 
 
 
505 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  42.04 
 
 
930 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  35.19 
 
 
755 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  36.24 
 
 
709 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  29.22 
 
 
426 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.44 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  36.17 
 
 
347 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  34.03 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  34.63 
 
 
459 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  34.45 
 
 
748 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  30.22 
 
 
1221 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32.84 
 
 
717 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  55.56 
 
 
574 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  26.91 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  27.59 
 
 
703 aa  76.6  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  25.3 
 
 
651 aa  72.8  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  28.46 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  24.85 
 
 
626 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
566 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  31.75 
 
 
335 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  27.07 
 
 
1194 aa  64.3  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  21.86 
 
 
1004 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 
378 aa  56.6  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  41.79 
 
 
1054 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
343 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  23.81 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  42.62 
 
 
1053 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  27.39 
 
 
332 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  30.82 
 
 
869 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
359 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  26.61 
 
 
312 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  21.48 
 
 
768 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  29.58 
 
 
347 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  45.76 
 
 
1146 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  35.23 
 
 
1204 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  21.25 
 
 
584 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  24.73 
 
 
461 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.06 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  29.17 
 
 
551 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 
335 aa  47.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  22.68 
 
 
601 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  21.56 
 
 
332 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  31.71 
 
 
501 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  21.33 
 
 
673 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 
1127 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 
1127 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>