110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1560 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 343 aa  707    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  48.19 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  54.03 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  50.8 
 
 		 335 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  47.87 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  38.36 
 
 		 900 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  39.35 
 
 		 584 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  30.26 
 
 		 566 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  28.61 
 
 		 814 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  34.1 
 
 		 545 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  26.49 
 
 		 378 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  30.4 
 
 		 469 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 359 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  25.35 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  29.23 
 
 		 589 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  25.76 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  27.24 
 
 		 572 aa  106  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  29.7 
 
 		 681 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  26.38 
 
 		 621 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  24.76 
 
 		 593 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  26.84 
 
 		 475 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 502 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  29.39 
 
 		 578 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  26.51 
 
 		 516 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  24.33 
 
 		 451 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  25.7 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  25.36 
 
 		 743 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  22.89 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  29.3 
 
 		 572 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  24.32 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  25.82 
 
 		 588 aa  82.8  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  27.74 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  27.37 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  23.74 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  25.19 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  24 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  24.29 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  28.48 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  23.37 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  25.25 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  22.93 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  23.55 
 
 		 420 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  23.75 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  24.05 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  22.7 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  23.91 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  20.07 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  26.88 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  24.45 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  19.54 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0251  glycoside hydrolase family 5  22.36 
 
 		 425 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  0.591379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  20.92 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  19.87 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  19.83 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  29.13 
 
 		 451 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4237  glycoside hydrolase family 5  21.94 
 
 		 653 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  28 
 
 		 630 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  23.25 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  25 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  20.15 
 
 		 561 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  19.49 
 
 		 468 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1473  glycoside hydrolase family 5  21.54 
 
 		 382 aa  52.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  20.45 
 
 		 1221 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  23.58 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  24.63 
 
 		 498 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  23.44 
 
 		 610 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  21.65 
 
 		 542 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  22.28 
 
 		 486 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  22.46 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  26.28 
 
 		 347 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  21.67 
 
 		 523 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  27.69 
 
 		 638 aa  49.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 717 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  31.78 
 
 		 459 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  22.41 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  23.43 
 
 		 930 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  21.24 
 
 		 556 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  20.19 
 
 		 363 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  26.45 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  22.5 
 
 		 525 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  31.78 
 
 		 459 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  23.85 
 
 		 755 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  18.95 
 
 		 673 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  24.21 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  25.74 
 
 		 1302 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  24.41 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  20.8 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  19.07 
 
 		 456 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  20.67 
 
 		 460 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  23.7 
 
 		 449 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  17.45 
 
 		 863 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>