59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4596 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
378 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  29.86 
 
 
900 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  27.67 
 
 
332 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  26.23 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  29.62 
 
 
584 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  27.45 
 
 
312 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  28.86 
 
 
566 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  27.31 
 
 
593 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  27.64 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  27.49 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  25.33 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 
814 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1473  glycoside hydrolase family 5  22.11 
 
 
382 aa  63.2  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  25.21 
 
 
578 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  22.39 
 
 
365 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  21.65 
 
 
535 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  24.47 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  25.99 
 
 
461 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
502 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  22.71 
 
 
475 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  24.83 
 
 
589 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  22.75 
 
 
469 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.79 
 
 
673 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  22.75 
 
 
621 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  25.1 
 
 
681 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  25.16 
 
 
491 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0022  hypothetical protein  20.86 
 
 
386 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 
501 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  23.35 
 
 
588 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  22.77 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  20.61 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  18.64 
 
 
481 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
411 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  26.46 
 
 
378 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  21.03 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  24.34 
 
 
516 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  26.18 
 
 
1194 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  21.69 
 
 
572 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  22.38 
 
 
551 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  22.76 
 
 
347 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  18.79 
 
 
456 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  27.5 
 
 
363 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  28.09 
 
 
378 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  17.51 
 
 
483 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
352 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  16.97 
 
 
481 aa  46.2  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4704  hypothetical protein  28.57 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  25.68 
 
 
480 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  23.39 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.95 
 
 
673 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  24.84 
 
 
337 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  23.66 
 
 
542 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  27.72 
 
 
709 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>