44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4946 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  100 
 
 		 322 aa  663    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  43.44 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  40.06 
 
 		 1302 aa  251  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  38.97 
 
 		 610 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  37.93 
 
 		 638 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  38.01 
 
 		 630 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  39.32 
 
 		 505 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  37.92 
 
 		 505 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  39.23 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  39.23 
 
 		 451 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  36.09 
 
 		 457 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  35.47 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  38.62 
 
 		 1167 aa  189  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  33.22 
 
 		 459 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  33.55 
 
 		 462 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  33.01 
 
 		 466 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  32.25 
 
 		 426 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  36.27 
 
 		 930 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  32.79 
 
 		 748 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  31.39 
 
 		 709 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  33.02 
 
 		 755 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  29.96 
 
 		 717 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  24.17 
 
 		 1221 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  25.16 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  22.93 
 
 		 626 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  21.24 
 
 		 1004 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 566 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  24.42 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  29.23 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  25.24 
 
 		 703 aa  56.2  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  20.62 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  24.43 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  24.39 
 
 		 551 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  29.29 
 
 		 312 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  24.69 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  19.73 
 
 		 1194 aa  46.2  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  20.2 
 
 		 445 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.4 
 
 		 900 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.24 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  24.18 
 
 		 768 aa  43.5  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  20.83 
 
 		 584 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  25.17 
 
 		 545 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>