70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1283 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
332 aa  682    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  41.01 
 
 
312 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  39.35 
 
 
335 aa  219  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  37.29 
 
 
332 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 
343 aa  198  9e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  28.02 
 
 
584 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  28.95 
 
 
378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.89 
 
 
900 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5064  glycoside hydrolase family 5  27.76 
 
 
378 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 
814 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  28.48 
 
 
566 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  28.07 
 
 
365 aa  92.4  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  26.75 
 
 
545 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  24.83 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  25.48 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.4 
 
 
501 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  29.57 
 
 
551 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  25.2 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  26.77 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  27.78 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  23.93 
 
 
743 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
556 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  27.17 
 
 
681 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  25.9 
 
 
572 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  23.1 
 
 
621 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  26.58 
 
 
505 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  24.32 
 
 
578 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  29.76 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  28.29 
 
 
593 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  25.23 
 
 
589 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 
502 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  28.15 
 
 
505 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  29.49 
 
 
340 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  20.71 
 
 
588 aa  55.8  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  26.09 
 
 
635 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  36.11 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  24.36 
 
 
572 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  21.23 
 
 
451 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  23.23 
 
 
426 aa  52.8  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  25.44 
 
 
349 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  27.39 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  26.63 
 
 
709 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  25.63 
 
 
566 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  25.64 
 
 
347 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.74 
 
 
717 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 
402 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  24.46 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  22.83 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  25.11 
 
 
626 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  22.07 
 
 
451 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  24.74 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0119  glycoside hydrolase family protein  21.66 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 
468 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  28.08 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.81 
 
 
673 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  22.5 
 
 
748 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  29.2 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  23.99 
 
 
376 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2362  glycosy hydrolase family protein  26.28 
 
 
491 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  22.8 
 
 
619 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  23.55 
 
 
337 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 
709 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5358  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 
414 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0701056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>