28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1758 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
387 aa  796    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  50.93 
 
 
434 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  50.66 
 
 
393 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  49.33 
 
 
395 aa  352  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  43.56 
 
 
436 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  43.23 
 
 
422 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.9 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 
501 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  23.84 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  22.18 
 
 
328 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 
343 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  26.19 
 
 
601 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  28.07 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  20.36 
 
 
377 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  21.5 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  22.01 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  21.56 
 
 
456 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  25.79 
 
 
588 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  31.2 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  24.1 
 
 
869 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  24.64 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  27.23 
 
 
573 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 
814 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>