196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5006 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 516 aa  1051    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  37.46 
 
 		 814 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  35.47 
 
 		 475 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  36.12 
 
 		 681 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  31.04 
 
 		 578 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  34.94 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 		 709 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4946  Cellulase  35.05 
 
 		 589 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0257714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  31.27 
 
 		 572 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  64.41 
 
 		 634 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  31.63 
 
 		 545 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0774  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 502 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2058  cellulase  29.53 
 
 		 469 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.33329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  50 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  49.38 
 
 		 391 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  32.48 
 
 		 743 aa  143  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  48.57 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  57.72 
 
 		 1072 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  52.38 
 
 		 492 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08068  extracellular endoglucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01830)  29.73 
 
 		 572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  29.66 
 
 		 584 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  30.41 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  55.2 
 
 		 732 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.15 
 
 		 933 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  50 
 
 		 803 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  43.02 
 
 		 890 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  31 
 
 		 566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  28.92 
 
 		 900 aa  120  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  49.61 
 
 		 801 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  42.07 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  52.42 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  50.41 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  45.6 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  44.14 
 
 		 1128 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  44.8 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  38.69 
 
 		 1207 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  46.55 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  47.15 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  39.49 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  44.96 
 
 		 603 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  37.67 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  44 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  49.15 
 
 		 627 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.62 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  47.06 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  40.98 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  43.66 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  48.76 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  35.92 
 
 		 801 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  27.61 
 
 		 335 aa  97.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  39.68 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  41.8 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  43.09 
 
 		 497 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.84 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  43.1 
 
 		 801 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  40.5 
 
 		 380 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  41.67 
 
 		 414 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  40.5 
 
 		 451 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  26.51 
 
 		 343 aa  92.4  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.28 
 
 		 568 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  38.1 
 
 		 535 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.99 
 
 		 312 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.5 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  39.34 
 
 		 500 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  38.14 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  38.92 
 
 		 165 aa  85.1  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  33.97 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  39.67 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.32 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  41.35 
 
 		 574 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  35.16 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  37.21 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.77 
 
 		 474 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  37.21 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  38.76 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.12 
 
 		 567 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.96 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  33.6 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  50.63 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.09 
 
 		 794 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.51 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.34 
 
 		 497 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  35.67 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.67 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  34.31 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  32.31 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  27.27 
 
 		 673 aa  67.4  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 332 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.51 
 
 		 1016 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  31.93 
 
 		 1413 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  38.78 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.82 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 		 571 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  30.12 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  33.54 
 
 		 186 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>