238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4199 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  100 
 
 		 474 aa  966    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  88.29 
 
 		 794 aa  498  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  51.32 
 
 		 686 aa  295  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  87.5 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.73 
 
 		 482 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  31.78 
 
 		 365 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  36.4 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  32.35 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  32.07 
 
 		 527 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  28.66 
 
 		 922 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  26.94 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  29.97 
 
 		 594 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  28.97 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  31.62 
 
 		 486 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  29.7 
 
 		 512 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  26.37 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  32.81 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.48 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  34.55 
 
 		 1413 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.37 
 
 		 494 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  31.73 
 
 		 449 aa  86.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  36.6 
 
 		 492 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  35.46 
 
 		 1259 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  33.73 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  31.22 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  28.63 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35 
 
 		 691 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.04 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  35.58 
 
 		 1139 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  36.23 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  36.43 
 
 		 672 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.86 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  26.16 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  33.82 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  32.02 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  39.84 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  33.57 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.69 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  31.98 
 
 		 563 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  37.34 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.33 
 
 		 476 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  36.36 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  38.67 
 
 		 576 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  36.36 
 
 		 1016 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  39.06 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  32.84 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  32.91 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  30.58 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  32.2 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  32.2 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  26.94 
 
 		 1316 aa  77  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  36 
 
 		 507 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  32.43 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  35.25 
 
 		 982 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.33 
 
 		 863 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.25 
 
 		 520 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.57 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  31.07 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.13 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  34.29 
 
 		 516 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  30.94 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  34.31 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  28.28 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  38.4 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  28.71 
 
 		 1409 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  35.77 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  35.06 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  33.12 
 
 		 2073 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  43.68 
 
 		 801 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.88 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  45.78 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  26.29 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  35.82 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  32.39 
 
 		 644 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.2 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  35.66 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  35.66 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  35.48 
 
 		 634 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  28.1 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  36.43 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  30.6 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.29 
 
 		 1072 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  31.16 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  31.65 
 
 		 571 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  31.39 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.74 
 
 		 991 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  29.52 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  29.9 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.15 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.88 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  29.18 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.54 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  43.75 
 
 		 803 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  27.56 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.21 
 
 		 933 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>