183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4941 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  100 
 
 		 380 aa  763    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  73 
 
 		 494 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  68.49 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  69.7 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  66.97 
 
 		 233 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  67.76 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  45.48 
 
 		 411 aa  292  8e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  72.08 
 
 		 767 aa  290  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  59.91 
 
 		 428 aa  279  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  64.06 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  70.31 
 
 		 343 aa  277  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  60.18 
 
 		 1001 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  58.72 
 
 		 225 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  64.92 
 
 		 692 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  61.41 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  50.88 
 
 		 524 aa  226  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  55.66 
 
 		 212 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  51.2 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  51.58 
 
 		 212 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  49.78 
 
 		 1160 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  43.6 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  45.96 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  45.29 
 
 		 683 aa  192  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  51.04 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  72.09 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  73.23 
 
 		 489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  71.09 
 
 		 801 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  58.9 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  71.09 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  70.87 
 
 		 472 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  72.22 
 
 		 498 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  70.87 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  67.72 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  64.34 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  65.08 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  63.49 
 
 		 500 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  59.52 
 
 		 374 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  57.35 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  59.52 
 
 		 489 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  60.33 
 
 		 558 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  60.32 
 
 		 535 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  53.39 
 
 		 801 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  51.47 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  51.85 
 
 		 589 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  53.44 
 
 		 603 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  46.32 
 
 		 548 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  51.2 
 
 		 497 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  50.75 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 221 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  49.21 
 
 		 568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  42.37 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  39.62 
 
 		 803 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  41.79 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  42.41 
 
 		 801 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  43.8 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  42.5 
 
 		 634 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  40.6 
 
 		 567 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  39.69 
 
 		 516 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  44.88 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.96 
 
 		 384 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  41.13 
 
 		 642 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.75 
 
 		 890 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  42.28 
 
 		 446 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  40.16 
 
 		 465 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  37.78 
 
 		 709 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.78 
 
 		 1072 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  38.46 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  27.94 
 
 		 274 aa  87  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.29 
 
 		 933 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  36.5 
 
 		 597 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  39.64 
 
 		 824 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.06 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  32.64 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  41.13 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  37.04 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.74 
 
 		 531 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  42.5 
 
 		 574 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  38.28 
 
 		 1016 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  36.72 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  35.82 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  39.17 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  37.5 
 
 		 1128 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  39.17 
 
 		 732 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.19 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.27 
 
 		 756 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  38.14 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  40 
 
 		 1207 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  34.75 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  36.22 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.69 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  35.48 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  38.89 
 
 		 495 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 580 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  33.08 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.85 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  33.59 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  38.46 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  32 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.34 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>