More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4113 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
815 aa  1619    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  74.52 
 
 
674 aa  363  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  70.94 
 
 
987 aa  347  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  71.54 
 
 
962 aa  342  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  55.59 
 
 
469 aa  334  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  46.44 
 
 
446 aa  327  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  62.45 
 
 
850 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  69.47 
 
 
1158 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  60.54 
 
 
581 aa  295  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.04 
 
 
639 aa  294  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  60.54 
 
 
578 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  56.84 
 
 
588 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  52.63 
 
 
752 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.79 
 
 
1007 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  50.19 
 
 
1581 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.43 
 
 
915 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  45.88 
 
 
1441 aa  221  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  42.36 
 
 
464 aa  220  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  45.45 
 
 
999 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  41.46 
 
 
479 aa  213  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.56 
 
 
1564 aa  207  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  41.97 
 
 
4013 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  43.84 
 
 
479 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  41.75 
 
 
470 aa  202  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  76.92 
 
 
755 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  40.15 
 
 
318 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.14 
 
 
1362 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  42.75 
 
 
1028 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  69.29 
 
 
433 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 
578 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  34.44 
 
 
423 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  55.56 
 
 
756 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  71.54 
 
 
940 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.51 
 
 
426 aa  156  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  63.36 
 
 
449 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  48.47 
 
 
637 aa  154  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.23 
 
 
1321 aa  154  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  56.62 
 
 
571 aa  152  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  34.13 
 
 
1471 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  34.15 
 
 
539 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.56 
 
 
953 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.68 
 
 
722 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  53.6 
 
 
392 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  54.4 
 
 
1070 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.2 
 
 
929 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  43.33 
 
 
801 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.85 
 
 
819 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  44.74 
 
 
1338 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  42.62 
 
 
1016 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  53.33 
 
 
452 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  53.6 
 
 
1103 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  48.39 
 
 
1059 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
1184 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  40.51 
 
 
732 aa  123  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  55.12 
 
 
1059 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.06 
 
 
971 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  50.39 
 
 
879 aa  121  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  48.39 
 
 
384 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50.7 
 
 
471 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.15 
 
 
729 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  50.86 
 
 
452 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  64.58 
 
 
622 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.38 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.2 
 
 
1117 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  53.38 
 
 
487 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.38 
 
 
487 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  46.1 
 
 
417 aa  112  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  43.55 
 
 
558 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  48.41 
 
 
732 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.3 
 
 
984 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.94 
 
 
1139 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  50.69 
 
 
470 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  46.62 
 
 
1332 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.02 
 
 
1448 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  66.67 
 
 
726 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  33.08 
 
 
289 aa  101  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.47 
 
 
633 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.24 
 
 
1072 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  65.93 
 
 
688 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.05 
 
 
472 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.05 
 
 
472 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  58.93 
 
 
1148 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  43.44 
 
 
1207 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  47.33 
 
 
475 aa  96.3  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  58.04 
 
 
884 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  36.71 
 
 
492 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.35 
 
 
933 aa  95.1  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.22 
 
 
470 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  40.68 
 
 
890 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  32.82 
 
 
283 aa  94.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  51.11 
 
 
672 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.76 
 
 
695 aa  94  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.53 
 
 
470 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  47.42 
 
 
634 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  32.36 
 
 
269 aa  92.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  68.6 
 
 
494 aa  91.3  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  27.84 
 
 
388 aa  90.9  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  59.8 
 
 
824 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  29.53 
 
 
409 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  62.5 
 
 
788 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>