98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4887 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 
581 aa  1183    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  84.36 
 
 
578 aa  993    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.73 
 
 
674 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  57.1 
 
 
987 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.95 
 
 
962 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  59.6 
 
 
1158 aa  283  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  52.94 
 
 
850 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  48.75 
 
 
588 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  59.77 
 
 
815 aa  240  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  45.55 
 
 
752 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  43.85 
 
 
1581 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  44.49 
 
 
1441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.42 
 
 
1564 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.42 
 
 
915 aa  173  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  41.54 
 
 
4013 aa  170  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  65.19 
 
 
1007 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  53.85 
 
 
722 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  56.52 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  62.88 
 
 
755 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  54.49 
 
 
571 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  57.83 
 
 
999 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.9 
 
 
756 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  38.81 
 
 
1028 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  60.9 
 
 
449 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 
1362 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  63.11 
 
 
940 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  39.54 
 
 
578 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  65.32 
 
 
639 aa  133  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.71 
 
 
953 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  50 
 
 
637 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.85 
 
 
819 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  51.18 
 
 
392 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.38 
 
 
1321 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  52.59 
 
 
452 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  30.03 
 
 
1471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.99 
 
 
929 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  44.97 
 
 
801 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  49.21 
 
 
1070 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 
1184 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.6 
 
 
984 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  54.05 
 
 
1338 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  42.06 
 
 
732 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.86 
 
 
971 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  50.4 
 
 
1059 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  47.46 
 
 
1103 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  39.38 
 
 
1332 aa  97.4  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.29 
 
 
471 aa  95.1  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.44 
 
 
1117 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.5 
 
 
729 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.79 
 
 
695 aa  94.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  42.86 
 
 
879 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  40.48 
 
 
558 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  44.6 
 
 
470 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  38.36 
 
 
1059 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.55 
 
 
1448 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.03 
 
 
480 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.28 
 
 
487 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  43.28 
 
 
487 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  32 
 
 
1139 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  27.59 
 
 
884 aa  84  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.01 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  43.94 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.29 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.28 
 
 
1060 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.15 
 
 
820 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  25.4 
 
 
726 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  30.42 
 
 
818 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  41.9 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.26 
 
 
722 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  40 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.45 
 
 
478 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.32 
 
 
112 aa  67  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.07 
 
 
393 aa  64.7  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  31.13 
 
 
2117 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.66 
 
 
396 aa  61.6  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.56 
 
 
531 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.73 
 
 
538 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.3 
 
 
929 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  28.95 
 
 
791 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  23.4 
 
 
768 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  32.11 
 
 
1368 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.69 
 
 
1038 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  32.17 
 
 
912 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  34.53 
 
 
1439 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  35.61 
 
 
644 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.17 
 
 
580 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
807 aa  50.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.33 
 
 
795 aa  50.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  53.19 
 
 
151 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  29.93 
 
 
557 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
807 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  34.93 
 
 
1200 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  28.89 
 
 
1061 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.92 
 
 
1212 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.86 
 
 
1109 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.66 
 
 
1246 aa  44.3  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>