102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4499 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  68.63 
 
 		 475 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  89.57 
 
 		 470 aa  847    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  90.43 
 
 		 487 aa  820    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 		 470 aa  949    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  90.43 
 
 		 487 aa  820    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  86.41 
 
 		 471 aa  828    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  89.79 
 
 		 480 aa  818    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  99.15 
 
 		 470 aa  944    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.22 
 
 		 472 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.22 
 
 		 472 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17510  hypothetical protein  42.58 
 
 		 335 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1520  hypothetical protein  42.07 
 
 		 335 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  53.62 
 
 		 452 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  51.8 
 
 		 571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  51.15 
 
 		 987 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.06 
 
 		 674 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.14 
 
 		 722 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.55 
 
 		 1158 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  45.65 
 
 		 588 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.44 
 
 		 729 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.96 
 
 		 953 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.84 
 
 		 639 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  45.71 
 
 		 850 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  45.65 
 
 		 433 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.97 
 
 		 962 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  42.42 
 
 		 392 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  45.32 
 
 		 449 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  48.18 
 
 		 801 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.33 
 
 		 815 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.03 
 
 		 929 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  46.15 
 
 		 1441 aa  86.7  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.35 
 
 		 1117 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.32 
 
 		 940 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  41.48 
 
 		 1070 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.09 
 
 		 756 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.94 
 
 		 1321 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  37.58 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 752 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  49.5 
 
 		 1338 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.08 
 
 		 971 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.11 
 
 		 1007 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.03 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.55 
 
 		 755 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  37.57 
 
 		 1581 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.29 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  39.84 
 
 		 637 aa  80.1  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  40.18 
 
 		 1471 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  46.62 
 
 		 999 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.39 
 
 		 984 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  36.67 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  47.73 
 
 		 1103 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.45 
 
 		 915 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.57 
 
 		 1059 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  36.57 
 
 		 879 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.6 
 
 		 1564 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.32 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 1332 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  35.11 
 
 		 732 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  35.04 
 
 		 1028 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 2117 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.68 
 
 		 1139 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  34.09 
 
 		 4013 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.92 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  41.79 
 
 		 1059 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  33.33 
 
 		 722 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.47 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.39 
 
 		 929 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 1184 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.64 
 
 		 820 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.12 
 
 		 1038 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  27.34 
 
 		 1061 aa  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1157  hypothetical protein  47.27 
 
 		 151 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.13 
 
 		 1362 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.36 
 
 		 112 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.04 
 
 		 1060 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  30 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  30 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.16 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  32.17 
 
 		 644 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  33.33 
 
 		 1010 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.14 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  28.95 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  33.94 
 
 		 818 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.95 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  24.66 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2220  WD40 domain protein beta Propeller  23.97 
 
 		 275 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661774  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  34.91 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1042 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  29.81 
 
 		 912 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  24.56 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  27.07 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  24.56 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  32.73 
 
 		 873 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  23.97 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.57 
 
 		 1448 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2041  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.29 
 
 		 277 aa  43.9  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.365131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  31.4 
 
 		 899 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.7 
 
 		 1040 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.48 
 
 		 1439 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  31.3 
 
 		 768 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>