More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2861 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.65 
 
 		 971 aa  1100    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 984 aa  2041    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 		 1144 aa  358  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  31.48 
 
 		 962 aa  332  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.47 
 
 		 878 aa  294  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 906 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.43 
 
 		 1362 aa  268  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.83 
 
 		 813 aa  194  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  25.93 
 
 		 813 aa  177  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.06 
 
 		 835 aa  173  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.82 
 
 		 1243 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  23.85 
 
 		 864 aa  167  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  24.31 
 
 		 863 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  22.41 
 
 		 1270 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  25.03 
 
 		 837 aa  159  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  22.65 
 
 		 823 aa  153  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.57 
 
 		 842 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.02 
 
 		 845 aa  151  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  25.1 
 
 		 860 aa  149  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.87 
 
 		 744 aa  148  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  23.83 
 
 		 837 aa  146  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 		 786 aa  144  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  24.76 
 
 		 891 aa  144  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 		 871 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 		 785 aa  142  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.19 
 
 		 845 aa  138  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  24.35 
 
 		 891 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 793 aa  130  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  26.44 
 
 		 880 aa  129  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  27.67 
 
 		 831 aa  128  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  21.96 
 
 		 802 aa  128  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 734 aa  126  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 763 aa  126  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  22.57 
 
 		 819 aa  126  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  21.68 
 
 		 802 aa  125  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  23.12 
 
 		 861 aa  124  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  22.72 
 
 		 839 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  23.5 
 
 		 833 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.04 
 
 		 872 aa  122  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  27.4 
 
 		 824 aa  122  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  46.32 
 
 		 1441 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 739 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 		 724 aa  118  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  22.25 
 
 		 897 aa  117  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  22.95 
 
 		 875 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  47.58 
 
 		 1103 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.19 
 
 		 953 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  42.86 
 
 		 1581 aa  116  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  41.67 
 
 		 1070 aa  114  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  45 
 
 		 801 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  44.35 
 
 		 392 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.87 
 
 		 884 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.6 
 
 		 722 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  25.3 
 
 		 819 aa  112  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.6 
 
 		 581 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.36 
 
 		 843 aa  108  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 925 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  26.86 
 
 		 840 aa  107  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  24.23 
 
 		 819 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.72 
 
 		 756 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.39 
 
 		 905 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  23.92 
 
 		 845 aa  105  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.16 
 
 		 962 aa  104  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 932 aa  104  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  26.7 
 
 		 812 aa  104  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  25.77 
 
 		 829 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.65 
 
 		 755 aa  104  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.61 
 
 		 986 aa  103  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  45.24 
 
 		 987 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.78 
 
 		 1158 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  23.11 
 
 		 815 aa  102  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.78 
 
 		 720 aa  102  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  27.58 
 
 		 846 aa  101  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.29 
 
 		 1321 aa  101  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  42.4 
 
 		 571 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.67 
 
 		 674 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.31 
 
 		 1007 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.65 
 
 		 1117 aa  98.6  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.86 
 
 		 805 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  40.16 
 
 		 433 aa  97.8  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  25.82 
 
 		 847 aa  97.8  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  42.52 
 
 		 637 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  42.75 
 
 		 999 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.53 
 
 		 815 aa  97.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.18 
 
 		 800 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 663 aa  96.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  22.83 
 
 		 821 aa  95.9  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  24.12 
 
 		 824 aa  95.9  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 752 aa  95.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.32 
 
 		 815 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.74 
 
 		 940 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.8 
 
 		 578 aa  95.1  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  44.62 
 
 		 449 aa  95.1  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  43.86 
 
 		 1338 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.1 
 
 		 609 aa  94.7  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.35 
 
 		 972 aa  94.4  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  26.48 
 
 		 811 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.02 
 
 		 818 aa  94.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  26.47 
 
 		 859 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  43.4 
 
 		 695 aa  93.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>