294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0992 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  49.4 
 
 		 925 aa  918    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3378  glycoside hydrolase family protein  46.45 
 
 		 984 aa  916    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  50.32 
 
 		 832 aa  730    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 932 aa  1903    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  41.99 
 
 		 805 aa  608  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3882  beta-galactosidase  41.8 
 
 		 961 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0857074  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2424  beta-galactosidase  39.84 
 
 		 964 aa  505  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.313743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 		 919 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1355  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 873 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  34.13 
 
 		 1015 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  37.25 
 
 		 928 aa  452  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.87 
 
 		 805 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.67 
 
 		 986 aa  447  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 		 827 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1941  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  36.39 
 
 		 903 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.615536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  34.86 
 
 		 806 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1719  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.99 
 
 		 922 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.02 
 
 		 794 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6171  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.71 
 
 		 813 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0434587  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  31.58 
 
 		 1355 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.96 
 
 		 824 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.429142  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06388  beta-galactosidase (Eurofung)  31.63 
 
 		 891 aa  365  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.72 
 
 		 811 aa  364  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  30.84 
 
 		 859 aa  357  7.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.79 
 
 		 1781 aa  352  3e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 		 1185 aa  337  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2935  beta-galactosidase  38.08 
 
 		 604 aa  328  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3111  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 		 806 aa  327  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.634657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2929  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 		 807 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.33 
 
 		 787 aa  317  7e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 858 aa  312  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.73 
 
 		 808 aa  293  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.99 
 
 		 837 aa  291  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3226  glycoside hydrolase family protein  30.43 
 
 		 829 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3159  glycoside hydrolase family protein  28.95 
 
 		 799 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  28.91 
 
 		 815 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3193  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 825 aa  264  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1608  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.88 
 
 		 1093 aa  258  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  28.44 
 
 		 862 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  28.84 
 
 		 803 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  28.57 
 
 		 750 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  26.7 
 
 		 743 aa  233  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  29.95 
 
 		 888 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  29.33 
 
 		 766 aa  224  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2527  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.76 
 
 		 882 aa  217  9e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.37 
 
 		 897 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 781 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  26.78 
 
 		 848 aa  201  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  28.12 
 
 		 824 aa  201  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  28.15 
 
 		 707 aa  201  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01699  beta-galactosidase  53.04 
 
 		 233 aa  199  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.96 
 
 		 781 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0832  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 979 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0225317  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 		 655 aa  191  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.38 
 
 		 704 aa  188  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.18 
 
 		 858 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  26.5 
 
 		 804 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  24.73 
 
 		 785 aa  174  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  26.24 
 
 		 804 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  32.01 
 
 		 972 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.57 
 
 		 748 aa  165  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  28.88 
 
 		 894 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 754 aa  161  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  25.59 
 
 		 717 aa  160  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.84 
 
 		 747 aa  159  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  27.14 
 
 		 1035 aa  158  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0539  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.55 
 
 		 913 aa  157  8e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.160142 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  26.17 
 
 		 1044 aa  154  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.72 
 
 		 1108 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  24.16 
 
 		 763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.88 
 
 		 1026 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.09 
 
 		 1289 aa  147  9e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 987 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.37 
 
 		 1171 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  25.65 
 
 		 1041 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 951 aa  145  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  26.71 
 
 		 1035 aa  144  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 		 1049 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  28.1 
 
 		 686 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.52 
 
 		 1030 aa  144  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  28.55 
 
 		 1020 aa  144  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  29.52 
 
 		 1030 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.52 
 
 		 1030 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1030 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.52 
 
 		 1030 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  25.49 
 
 		 1019 aa  143  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.52 
 
 		 1030 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  28.81 
 
 		 1030 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  28.3 
 
 		 1043 aa  142  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.25 
 
 		 1033 aa  141  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 1175 aa  141  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 		 1079 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 		 1077 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  27.82 
 
 		 1008 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  26.57 
 
 		 1455 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  29.05 
 
 		 1030 aa  139  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.88 
 
 		 1053 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.7 
 
 		 1033 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.93 
 
 		 1036 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 		 1017 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>