More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3805 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 801 aa  1633    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  37.82 
 
 		 578 aa  244  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.98 
 
 		 1321 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  36.68 
 
 		 536 aa  167  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  37.38 
 
 		 1338 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.02 
 
 		 953 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  50.6 
 
 		 1132 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  59.7 
 
 		 1059 aa  154  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  33.68 
 
 		 1115 aa  153  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  55 
 
 		 915 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  46.88 
 
 		 1295 aa  147  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  45.81 
 
 		 524 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.69 
 
 		 933 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  46.48 
 
 		 855 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  50.39 
 
 		 1070 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  36.45 
 
 		 630 aa  129  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.12 
 
 		 962 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  42.54 
 
 		 972 aa  128  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  52.67 
 
 		 571 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  47.68 
 
 		 823 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  46.75 
 
 		 870 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 1799 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.31 
 
 		 815 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  48 
 
 		 1262 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  46.53 
 
 		 1356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.07 
 
 		 1158 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.14 
 
 		 639 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  48.06 
 
 		 392 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  46.58 
 
 		 1380 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.21 
 
 		 819 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  42.42 
 
 		 987 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.38 
 
 		 756 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  46.76 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  41.26 
 
 		 798 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  41.71 
 
 		 918 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 752 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  41.94 
 
 		 1035 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  38.95 
 
 		 982 aa  118  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  44.3 
 
 		 802 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  42.95 
 
 		 1234 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 845 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.56 
 
 		 819 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.97 
 
 		 581 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  43.05 
 
 		 581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  39.58 
 
 		 850 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  53.77 
 
 		 452 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  44.1 
 
 		 786 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.97 
 
 		 637 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.14 
 
 		 1007 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.69 
 
 		 1564 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.17 
 
 		 971 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  50.39 
 
 		 674 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  30.24 
 
 		 526 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  51.56 
 
 		 940 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.44 
 
 		 755 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  44.44 
 
 		 1581 aa  114  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  41.77 
 
 		 1707 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  45 
 
 		 984 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  45.1 
 
 		 735 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 627 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  47.24 
 
 		 1441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  39.13 
 
 		 919 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.83 
 
 		 2554 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  45.21 
 
 		 777 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  46.32 
 
 		 999 aa  111  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 541 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1024 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  46.62 
 
 		 1732 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  45.31 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40 
 
 		 578 aa  109  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  33.49 
 
 		 954 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  34.2 
 
 		 550 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  41.55 
 
 		 948 aa  109  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  43.84 
 
 		 840 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  42.18 
 
 		 966 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  46.09 
 
 		 1059 aa  107  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  41.5 
 
 		 500 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.37 
 
 		 722 aa  107  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 1004 aa  107  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  34.43 
 
 		 827 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.45 
 
 		 929 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  42.28 
 
 		 719 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  48.18 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  45 
 
 		 558 aa  106  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  33.62 
 
 		 1332 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.06 
 
 		 3295 aa  104  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 749 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  47.37 
 
 		 1103 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  36.99 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  43.7 
 
 		 732 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1167 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.42 
 
 		 729 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  40.97 
 
 		 522 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  36.05 
 
 		 739 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.52 
 
 		 1117 aa  97.4  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.35 
 
 		 1139 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  42.19 
 
 		 4013 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.38 
 
 		 1362 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 930 aa  94.4  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  37.33 
 
 		 879 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>