134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1961 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 524 aa  1021    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  84.39 
 
 		 411 aa  415  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0437  endo-1,4-beta-xylanase  59.62 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.555653  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  57.21 
 
 		 333 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.345913 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2383  Endo-1,4-beta-xylanase  59.9 
 
 		 428 aa  257  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0902343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1213  xylanase  62.63 
 
 		 338 aa  256  8e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3061  xylanase/chitin deacetylase-like  61.58 
 
 		 767 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000494565  decreased coverage  0.00000302702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0742  Endo-1,4-beta-xylanase  52.54 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0679137  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0246  Endo-1,4-beta-xylanase  58.33 
 
 		 343 aa  242  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4237  Endo-1,4-beta-xylanase  54.55 
 
 		 233 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  56.86 
 
 		 380 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03613  Endo-1,4-beta-xylanase A Precursor (Xylanase A)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase A)(22 kDa xylanase)(Xylanase X22) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55332]  54.5 
 
 		 225 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102967  normal  0.0469624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  51.75 
 
 		 1001 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  56.7 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09365  Endo-1,4-beta-xylanase B Precursor (Xylanase B)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase B)(24 kDa xylanase)(Xylanase X24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P55333]  59.14 
 
 		 221 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00048872  normal  0.0239037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0244  glycoside hydrolase family 11  56.32 
 
 		 692 aa  225  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0089  Endo-1,4-beta-xylanase  47.71 
 
 		 357 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  46.7 
 
 		 1160 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  37.36 
 
 		 683 aa  200  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0243  Endo-1,4-beta-xylanase  49.75 
 
 		 356 aa  194  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000283811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0750  glycoside hydrolase family 11  51.23 
 
 		 298 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2105  endo-1,4-beta-xylanase  52.57 
 
 		 212 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1866  glycoside hydrolase family 11  44.2 
 
 		 212 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0462  Endo-1,4-beta-xylanase  44.91 
 
 		 337 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  45.34 
 
 		 801 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  41.88 
 
 		 1295 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  59.29 
 
 		 768 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  35.32 
 
 		 1387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  41.18 
 
 		 982 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.11 
 
 		 933 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  41.46 
 
 		 630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 739 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  31.45 
 
 		 1132 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  40.97 
 
 		 526 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  41.88 
 
 		 918 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  38.96 
 
 		 798 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  65.06 
 
 		 831 aa  106  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2117  glycoside hydrolase family protein  32.71 
 
 		 221 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  43.24 
 
 		 870 aa  103  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 		 1356 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.95 
 
 		 845 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 		 819 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  41.03 
 
 		 1004 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.49 
 
 		 823 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  41.22 
 
 		 802 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  51.49 
 
 		 523 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  39.16 
 
 		 855 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1167 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  37.58 
 
 		 972 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  35.9 
 
 		 1035 aa  97.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  51.11 
 
 		 600 aa  97.1  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  38.06 
 
 		 966 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38.85 
 
 		 719 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  38.31 
 
 		 1799 aa  94  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  45.27 
 
 		 786 aa  94  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  35.03 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.55 
 
 		 550 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  38.12 
 
 		 875 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 777 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  37.18 
 
 		 840 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  42.45 
 
 		 581 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1595  xylanase  34.65 
 
 		 274 aa  91.3  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  39.58 
 
 		 1234 aa  90.9  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  41.84 
 
 		 948 aa  90.5  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40.14 
 
 		 1380 aa  90.5  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  36.77 
 
 		 954 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.57 
 
 		 1321 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  36.73 
 
 		 1732 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.35 
 
 		 1262 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  37.41 
 
 		 2554 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.97 
 
 		 1338 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  32.62 
 
 		 930 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  35.95 
 
 		 3295 aa  84  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  36.62 
 
 		 919 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  45.98 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  41.01 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1024 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  34.72 
 
 		 1707 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  36.84 
 
 		 735 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  37.41 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 749 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 705 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  41.41 
 
 		 569 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  31.86 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.63 
 
 		 627 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  33.57 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  36.61 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.22 
 
 		 863 aa  63.9  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  36.36 
 
 		 1391 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  36.15 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  33.01 
 
 		 869 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3070  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.86 
 
 		 1091 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.94 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  29.73 
 
 		 853 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.08 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  36.45 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  34.23 
 
 		 726 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  35.8 
 
 		 623 aa  57  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>